[发明专利]一种与肝硬化相关的肝内菌群标志物及其应用

说明书

本发明公开了一种与肝硬化相关的肝内菌群标志物及其应用，所述肝内菌群标志物为Stenotrophomonas maltophilia(S.maltophilia，嗜麦芽窄食单胞菌)。发明人通过收集肝硬化患者与正常人群的组织样本，由样本中的微生物出发，筛选出其中与肝硬化相关性较高的肝内菌群，利用此类菌群作为肝硬化生物标志物，可以有效用于肝硬化患者的诊断。

技术领域

本发明属于微生物组学和医学分子生物学技术领域，具体涉及一种与肝硬化相关的肝内菌群标志物及其应用。

背景技术

肝硬化是临床常见的慢性进行性肝病，由一种或多种病因长期或反复作用形成的弥漫性肝损害。在我国大多数为肝炎后肝硬化，少部分为酒精性肝硬化。肝硬化是肝细胞发生坏死及炎症刺激时，肝脏内纤维结缔组织异常增生的病理过程；过度纤维化使肝脏萎缩变硬，最终引起肝硬化失代偿或肝功能衰竭而导致患者死亡。尽管有肝移植手术能够从根本治疗终末期肝硬化及其并发症，但由于发病率高，加之供肝匮乏、围术期风险高，肝移植仅使微乎其微的患者受益，大部分患者还是死于其并发症。

最近，人们发现肿瘤组织中而不是肠道或口腔中的菌群与肿瘤的发展密切相关。肿瘤内细菌类型、菌群在特定肿瘤类型以及肿瘤亚型中的预测功能与患者的吸烟状况、肿瘤免疫疗法敏感性之间存在相关性。但目前，其他疾病的组织内相关菌群尚未有报道。

发明内容

本发明的目的之一在于提供了一种与肝硬化相关的肝内菌群标志物。本发明首次提出肝内菌群嗜麦芽窄食单胞菌的丰度与肝硬化有正相关性、嗜麦芽窄食单胞菌的丰度可作为肝硬化生物标志物，并且揭示嗜麦芽窄食单胞菌在肝硬化疾病中的促进作用，为肝硬化的治疗提供基础。

本发明的目的之二在于提供了一种用于诊断肝硬化的产品。

本发明的目的之三在于提供了一种用于诊断肝硬化的系统。

本发明的第一方面提供了一种诊断肝硬化的肝内菌群标志物，所述肝内菌群标志物为Stenotrophomonas maltophilia(S.maltophilia，嗜麦芽窄食单胞菌)。

本发明的第二方面提供了本发明的第一方面所述的肝内菌群标志物在制备用于诊断肝硬化的产品中的应用，所述产品包括检测肝内菌群标志物的试剂。

进一步，所述试剂是对所述肝内菌群标志物具有特异性的探针、引物或抗体。

进一步，所述引物是特异性扩增所述肝内菌群标志物的16SrRNA的引物。

本发明的第三方面提供了本发明的第一方面所述的肝内菌群标志物诊断肝硬化的系统，包括：

核酸样本分离单元，用于从检测对象中分离肝内菌群核酸样本；

测序单元，用于对分离的肠道菌群核酸样本进行测序，以获得测序结果；

数据处理单元，用于根据测序结果，对肠道菌群中的所述微生物标志物的相对丰度进行检测，将所得到的相对丰度值进行分析，得出上述微生物标志物的临界值；

结果判定单元，用于将数据处理单元得到的微生物标志物的临界值与设定诊断值进行比较。

利用该系统，可以检测出被发明的标志物在肝内菌群中的相对丰度。因此，可以通过得到的相对丰度与预定的临界值进行比较，从而确定对象个体是否为肝硬化患者以及疾病进程。

本发明的第四方面提供了一种诊断肝硬化的试剂盒，包括检测本发明的第一方面所述的肝内菌群标志物丰度的试剂。

进一步，所述试剂包括检测所述肝内菌群标志物的特异性的探针、引物或抗体。

进一步，所述特异性的引物是能够检测所述肝内菌群标志物16SrRNA的引物。

进一步，所述产品还包括提取微生物基因组DNA等的试剂。