[发明专利]一种抑制DDX17相关RNA表达产物的核苷酸及其应用

说明书

本发明公开了一种抑制DDX17相关RNA表达产物的核苷酸及其应用，其特征是：所述的核苷酸特异性的抑制DDX17基因的mRNA和相关的四个环状RNA，所述核苷酸的序列是：CGCCGAAAGAAGGAGAUUA或GGGAGAUGUUUGUCCUAAA或者GGUUGAUGAGCUACGCCGA及其互补序列。本发明核苷酸能够有效抑制A549和MDA‑MB‑231细胞中DDX17基因的mRNA和相关的四个环状RNA表达，并减少A549和MDA‑MB‑231细胞生存，与抗肿瘤药物联合可以增加抗肿瘤的效果。

技术领域

本发明属于分子生物和药物领域，具体地本发明涉及一种抑制DDX17相关RNA表达产物的核苷酸及其应用。该核苷酸可抑制DDX17mRNA，hsa_circ_0001230, hsa_circ_0063328, hsa_circ_0002211, hsa_circ_00633315 个RNA的表达，也可以与其他抗肿瘤药物联合作用。

背景技术

单链共价闭合环在1976年首次被报道为类病毒，是某些植物的病原体，1979年首次通过电子显微镜在人类HeLa细胞中检测到。高通量RNA测序和生物信息学工具的发展，科学家发现circRNA是人类转录组的一个普遍特征，在许多其他后生动物中普遍存在。最近，越来越多的研究发现了circRNAs的多种功能，包括作为蛋白质支架或miR海绵以及被翻译成多肽。

circRNAs的独特结构使其半衰期更长，对RNase R的抵抗力比线性RNAs长，这使其成为诊断生物标志物和治疗靶点的潜在候选物。大量的研究已经揭示了它们独特的表达特征和在多种疾病中的重要生物学作用，如癌症、心血管疾病、神经系统疾病和自身免疫性疾病。

DDX17以保守的基序Asp-Glu-Ala-Asp（DEAD）为特征的DEAD盒蛋白是推定的RNA解旋酶。 它们涉及许多涉及RNA二级结构改变的细胞过程，例如翻译起始，核和线粒体剪接以及核糖体和剪接体组装。 该基因编码DEAD盒蛋白，它是一种被多种RNA而非dsDNA激活的ATPase。 这种蛋白质以及由DDX5基因编码的蛋白质，彼此之间的关系比与DEAD盒家族的其他成员的关系更紧密。 由于交替剪接和使用交替翻译起始密码子，该基因可编码多种同工型。在癌症的生长中起到重要作用。

RNA干扰(RNA interference，RNAi)技术利用双链小RNA高效、特异性降解细胞内同源RNA从而沉默靶基因，从而实现干扰靶基因的功能。最近RNA干扰的药物逐步回到了历史的舞台。

发明内容

本发明的目的在于提供一种抑制DDX17相关RNA表达产物的核苷酸及其应用。

本发明的目的是这样实现的，包括合成核苷酸的序列由CGCCGAAAGAAGGAGAUUA(SEQ ID NO.1) 或GGGAGAUGUUUGUCCUAAA(SEQ ID NO.2)或者GGUUGAUGAGCUACGCCGA(SEQID NO.3)互补序列。所述核苷酸可被氟代修饰、硫代修饰、甲氧基修饰、胆固醇修饰一种或几种修饰。该核苷酸可以在制备抗肿瘤药物中的应用，例如治疗肺癌、乳腺癌。也可以和其他抗肿瘤治疗药物联合使用，例如三氧化二砷。本研究有云南省创新团队培育项目(202005AE160002)资助。

本发明（优点）：发明的核苷酸具有很好的DDX17相关RNA抑制效果，作用于特异性的靶位点，而且同时对5个相关RNA作用，作用强，特异性强、毒性低、副作用小，经过修饰后修饰半衰期长，可以与多种抗肿瘤药物合用。

附图说明