[发明专利]一种DNA甲基化表观修饰的识别方法、识别设备及存储介质

权利要求书

1.一种DNA甲基化表观修饰的识别方法，其特征在于，所述方法包括：

通过固态纳米孔测序获取待甲基化碱基识别的甲基化物种原始电信号；

采用预设算法解析识别所述原始电信号，进行甲基化碱基识别。

2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，在所述通过固态纳米孔测序获取待甲基化碱基识别的甲基化物种原始电信号之前，所述方法包括：按照不同物种构建不同物种的碱基识别模型，通过所述碱基识别模型确定待甲基化碱基识别的甲基化物种。

3.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述预设算法包括：对无甲基化物种的原始电信号采用循环神经网络进行训练，得到训练后循环神经网络；采用所述训练后循环神经网络，对待甲基化碱基识别的甲基化物种原始电信号进行甲基化碱基识别。

4.如权利要求3所述的方法，其特征在于，所述对无甲基化物种的原始电信号采用循环神经网络进行训练，得到训练后循环神经网络；包括：

将无甲基化物种的原始电信号Event特征值作为k-mers标签输入到循环神经网络进行训练；

使用预设嵌入编码算法对标签进行编码，确定与每一标签对应的每个碱基有与应的编码；

将经过编码形成的5*4向量矩阵打平为一个高维向量；

采用具有LSTM的双向RNN模型对所述高维向量进行碱基识别，得到训练后循环神经网络。

5.如权利要求4所述的方法，其特征在于，所述预设嵌入编码算法为one-hot编码算法。

6.如权利要求4所述的方法，其特征在于，所述采用具有LSTM的双向RNN模型对所述高维向量进行碱基识别，得到训练后循环神经网络；包括：

将所述高维向量输入到具有LSTM的双向RNN模型中，在所述双向RNN模型的输出层设置20个单元并经softmax处理；

对于输出向量的前4个分量，取概率最大的一个值为识别出的k-mers标签的第一个位置对应碱基；

对于后4个分量再取其中的概率最大值，为k-mers标签的第二个位置对应碱基；

直到从最后4个分量中识别出k-mers标签的最后一个位置对应碱基；

根据上述方法识别出一个原始电信号Event对应的一串k-mers，得到训练后循环神经网络。

7.如权利要求3至6任一项所述的方法，其特征在于，采用所述训练后循环神经网络，对待甲基化碱基识别的甲基化物种原始电信号进行甲基化碱基识别；包括：

将待甲基化碱基识别的甲基化物种的原始电信号Event特征值作为k-mers标签输入到所述训练后循环神经网络；

使用预设嵌入编码算法对标签进行编码，确定与每一标签对应的每个碱基有与应的编码；

将经过编码形成的5*5向量矩阵打平为一个高维向量；

采用具有LSTM的双向RNN模型对所述高维向量进行碱基识别，得到待甲基化碱基识别的甲基化物种的甲基化碱基类型。

8.如权利要求7所述的方法，其特征在于，采用所述训练后循环神经网络，对待甲基化碱基识别的甲基化物种原始电信号进行甲基化碱基识别；包括：

将所述高维向量输入到具有LSTM的双向RNN模型中，在所述双向RNN模型的输出层设置25个单元并经softmax处理；

对于输出向量的前5个分量，取概率最大的一个值为识别出的k-mers标签的第一个位置对应碱基；

对于后5个分量再取其中的概率最大值，即为k-mers标签的第二个位置对应碱基；

直到从最后5个分量中识别出k-mers标签的最后一个位置对应碱基；

根据上述方法识别出一个原始电信号Event对应的一串k-mers，得到待甲基化碱基识别的甲基化物种的甲基化碱基类型。

9.一种识别设备，其特征在于，包括：存储器、处理器及存储在所述存储器上并可在所述处理器上运行的计算机程序，所述计算机程序被所述处理器执行时实现如权利要求1至8中任一项所述的一种DNA甲基化表观修饰的识别方法的步骤。

10.一种存储介质，其特征在于，所述存储介质上存储有一种DNA甲基化表观修饰的识别方法程序，所述一种DNA甲基化表观修饰的识别方法的程序被处理器执行时实现如权利要求1至8中任一项所述的一种DNA甲基化表观修饰的识别方法的步骤。