[发明专利]一种提高基因编辑技术安全性的方法及系统在审
申请号: | 202110068001.X | 申请日: | 2021-01-19 |
公开(公告)号: | CN112750499A | 公开(公告)日: | 2021-05-04 |
发明(设计)人: | 李晓光 | 申请(专利权)人: | 无锡市第五人民医院 |
主分类号: | G16B20/50 | 分类号: | G16B20/50;G16B20/30;G16B20/00;G16B40/20;G16B30/10 |
代理公司: | 南通毅帆知识产权代理事务所(普通合伙) 32386 | 代理人: | 彭科 |
地址: | 214000 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 提高 基因 编辑 技术 安全性 方法 系统 | ||
1.一种提高基因编辑技术安全性的方法,其中,所述方法包括:
获得进行基因编辑的第一外源基因;
获得所述第一外源基因导入后的第一细胞基因序列信息;
根据所述第一外源基因获得易脱靶的第一基因区域;
根据所述第一细胞基因序列信息和所述第一基因区域获得所述第一基因区域内的第二细胞基因序列信息;
将所述第二细胞基因序列信息输入第一训练模型中,所述第一训练模型通过多组训练数据训练获得,所述多组中的训练数据中的每一组训练数据均包括:第二细胞基因序列信息,以及标识所述第二细胞基因序列是否满足预定条件的结果信息;
获得所述第一训练模型的第一输出信息,其中,所述第一输出信息标识所述第二细胞基因序列是否满足预定条件的结果信息;
当所述第一输出信息满足所述预定条件时,获得基因编辑技术安全性的第一结果。
2.如权利要求1所述的方法,其中,当所述第一输出信息满足所述预定条件时,所述方法还包括:
根据所述第一外源基因获得不易脱靶的第二基因区域;
根据所述第一细胞基因序列信息和所述第二基因区域获得所述第二基因区域内的第三细胞基因序列信息;
将所述第三细胞基因序列信息输入第二训练模型中,所述第二训练模型通过多组训练数据训练获得,所述多组中的训练数据中的每一组训练数据均包括:第三细胞基因序列信息,以及标识所述第三细胞基因序列信息是否满足所述预定条件的结果信息;
获得所述第二训练模型的第二输出信息,其中,所述第二输出信息标识所述第三细胞基因序列是否满足所述预定条件的结果信息;
当所述第二输出信息表示满足所述预定条件时,获得基因编辑技术安全性的第二结果。
3.如权利要求1所述的方法,获得第一外源基因导入后的第一细胞基因序列信息后,所述方法还包括:
将所述第一细胞基因序列信息输入至第一预测模型;
获得第一潜在脱靶位点信息;
将所述第一潜在脱靶位点信息输入至第一比对模型。
4.如权利要求3所述的方法,其中,获得所述第一基因区域内的第二细胞基因序列信息之后,所述方法还包括:
将所述第二细胞基因序列信息输入至所述第一预测模型;
获得第二潜在脱靶位点信息;
将所述第二潜在脱靶位点信息输入至所述第一比对模型;
由所述第一比对模型输出第一比对结果;
依据所述第一比对结果,确定所述第一基因区域。
5.如权利要求1所述的方法,其中,所述方法包括:
获得基因编辑的第一外源基因之后,所述方法还包括:
获得所述第一外源基因的第一品种信息;
依据所述第一品种信息获得所述第一外源基因的第一参考组基因信息;
依据所述第一参考组基因信息获得第一靶标信息;
依据所述第一靶标信息将所述第一外源基因进行导入。
6.如权利要求1所述的方法,其中,所述方法包括:
根据所述第一细胞基因序列信息生成第一验证码,其中,所述第一验证码是与所述第一细胞基因序列信息相对应;
根据所述第二细胞基因序列信息和所述第一验证码生成第二验证码;以此类推,根据第N细胞基因序列信息和第N-1验证码生成第N验证码,其中,N为大于1的自然数;
将各个细胞基因序列信息和相应的验证码分别作为一个存储单元,将各存储单元分别复制保存在M台设备上,其中,M为大于1的自然数。
7.如权利要求6所述的方法,其中,所述方法包括:
将所述第N细胞基因序列信息和所述第N验证码作为第N存储单元;
获得所述第N存储单元记录时间,所述第N存储单元记录时间表示第N存储单元需要记录的时间;
根据所述第N存储单元记录时间,获得所述M台设备中内存最大的第一设备;
将所述第N存储单元的记录权发送给所述第一设备。
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