[发明专利]细菌OM27_clade在制备用于耐重金属辣椒品种分类的工具中的应用

说明书

本发明公开了细菌OM27_clade在制备用于耐重金属辣椒品种分类的工具中的应用。在具体实施例中，本发明通过提取不同聚类分组的耐重金属辣椒的土壤DNA并测序，验证在不同聚类分组中OM27_clade的相对丰度差异，证明OM27_clade可应用于耐重金属辣椒品种分类。本发明提供了一种耐重金属辣椒品种分类的方法。

技术领域

本发明涉及生物技术和农业领域，具体涉及细菌OM27_clade在制备用于耐重金属辣椒品种分类的工具中的应用。

背景技术

我国土壤重金属污染形势严峻。近年来，我国土壤重金属污染事件频发，不仅对耕地与农产品质量构成严重威胁，还直接损害了民众身体健康，影响社会稳定。导致土壤环境产生污染的重金属主要有汞(Hg)、镉(Cd)、铅(Pb)、准金属砷(As)等生物毒性显著的元素，也包括有一定毒性的锌(Zn)、铜(Cu)、钴(Co)等常见元素。重金属在土壤中不能为微生物分解，因而会在土壤中不断积累，影响土壤性质，甚至可以转化为毒性更大的烷基化合物，被植物和其他生物吸收、富集，进而通过食物链在人、畜体内蓄积，直接影响植物、动物甚至人类健康。

辣椒是人们喜爱的蔬菜和调味品。我国在世界上拥有最大的辣椒种植和消费量，我国辣椒种植面积居蔬菜作物第二位，仅次于白菜。在四川、重庆、贵州、云南、湖南、江西、甘肃等地区，辣椒已成为当地的重要经济来源和主要支柱产业。辣椒生产加工的行业发展迅速，辣椒制品的种类日益增多，辣椒制品的交易额逐渐增长，部分产品还成为了我国重要的出口创汇产品。辣椒品种优化及安全高效生产在我国及区域性农业经济发展中发挥着重要的作用。有研究表明，重金属镉和汞是辣椒制品的主要污染元素并有超标现象出现。目前减少辣椒中重金属含量最经济、最有效的方法，就是通过选育重金属低积累辣椒品种来降低辣椒可食部位的重金属含量。

发明内容

本发明的目的是提供一种用于耐重金属辣椒品种分类的工具，为耐重金属辣椒品种的分类提供一种方法。

本发明一方面提供了一种用于耐重金属辣椒品种分类的工具，所述的工具包括检测OM27_clade的产品。

重金属为相对密度在4.5g/cm³以上的金属，本发明中所述的重金属包括但不限于铜、铅、锌、锡、镍、钴、锑、汞、镉或铋。

进一步，所述的重金属为镉。

进一步，所述的产品包括能检测OM27_clade含量或丰度的试剂。

进一步，所述的产品包括试剂盒、芯片或高通量测序平台。

本发明所述的试剂盒可包括可密封的容器，所述可密封的容器被配置为接收生物样品。试剂盒可包括多核苷酸引物。所述的多核苷酸引物可被配置用于扩增来自OM27_clade的16SrRNA多核苷酸序列以形成扩增的16S rRNA多核苷酸序列。试剂盒可包括用于检测扩增的16S rRNA序列的检测试剂。试剂盒可包括使用说明书。

所述的试剂盒还可包括用识别微生物特异性蛋白质的抗体包被的试纸条、洗涤溶液、进行该试验的试剂、蛋白质分离或纯化工具、检测工具以及阳性和阴性对照。这样的试剂盒可以采用例如试纸条、膜、芯片、盘、测试条、滤器、微球、载片、多孔板或光纤。所述的试剂盒的固相支持物可以是例如塑料、硅片、金属、树脂、玻璃、膜、颗粒、沉淀物、凝胶、聚合物、薄片、球、多糖、毛细管、胶片、板或载片。

术语“16S”、“16S核糖体亚基”和“16S核糖体RNA(rRNA)”可在本文中互换使用，并且可指指构成原核生物核糖体的30S小亚单位的rRNA，其一方面碱基序列的大部分被高度保留，另一方面部分区域显示出高的碱基序列多样性。特别是在同种之间几乎不存在多样性而异种间显示出多样性，因此通过比较16S rRNA的序列，能够有效鉴定原核生物。