[发明专利]一种分子筛选方法和计算设备

权利要求书

1.一种分子筛选方法，适于在计算设备中执行，所述方法包括步骤：

获取目标靶点的结构文件，所述结构文件为配体结构文件或受体结构文件或受体-配体复合物结构文件，所述配体结构文件包括多个配体分子，所述受体结构文件包括受体分子，所述受体-配体复合物结构文件包括配体分子和受体分子；

提取所述结构文件所对应的药效团，作为所述目标靶点的药效团模型；

对候选分子库中的每个候选分子进行构象搜索，得到每个候选分子所对应的多个构象；以及

将每个候选分子的每个构象分别与所述药效团模型对齐，得到对齐度满足预定条件的多个候选分子作为目标分子。

2.如权利要求1所述的方法，其中，若该多个配体分子以分子结构的序列表达式表示，则所述提取所述结构文件所对应的药效团的步骤包括：

对每个配体分子生成预定数目的构象，并分别提取每个构象的药效团；

获取预设的参照分子的至少一个药效团，并将每个配体的多个构象分别与所述参照分子的药效团对齐，得到该多个配体与所述参照分子的共同药效团，作为所述结构文件所对应的药效团。

3.如权利要求2所述的方法，其中，将每个配体的多个构象分别与所述参照分子的药效团对齐，得到该多个配体与所述参照分子的共同药效团的步骤包括：

对于每个配体，从对应的多个构象的药效团中选取与参照分子的药效团重合度最高的药效团；

若所选取的药效团与所述参照分子的药效团类型相同且球心间距在预设范围，则确定该药效团为该配体与所述参照分子的共同药效团。

4.如权利要求1所述的方法，其中，若该多个配体分子以三维构象文件表示，则所述结构文件所对应的药效团的步骤包括：

分别提取每个配体的药效团，并将球心间距在预设范围的同类型药效团进行合并，得到该多个配体的共同药效团，作为所述结构文件所对应的药效团。

5.如权利要求4所述的方法，其中，所述将球心间距在预设范围的同类型药效团进行合并的步骤包括：

将球心间距小于等于1埃的同类型药效团合并为1个，合并后药效团的球心为参与合并的药效团的球心坐标的中心位置。

6.如权利要求1-5中任一项所述的方法，其中，

所述药效团通过坐标、类型、球心坐标和半径中的至少一种方式表示；

所述类型包括氢键供体、氢键受体、芳香环、疏水相互作用、正电荷、负电荷中的至少一种。

7.如权利要求1-6中任一项所述的方法，其中，所述受体结构文件为用户输入的受体文件，所述受体文件包括受体分子和用户指定的氨基酸口袋位置和口袋大小；所述提取所述结构文件所对应的药效团的步骤包括：

基于所指定的口袋位置和口袋大小，提取该受体分子所对应的药效团作为一个药效团模型。

8.如权利要求1-7中任一项所述的方法，所述受体-配体复合物结构文件为用户输入的复合物文件，所述复合物文件包括受体分子和配体信息；所述提取所述结构文件所对应的药效团的步骤包括：

基于所述配体信息确定受体分子的口袋位置和口袋大小，并基于该口袋位置和口袋大小，通过配体结构和受体结构，以及可产生配体-受体结构间相互作用的基团，提取该复合物所对应的药效团作为一个药效团模型。

9.一种计算设备，包括：

存储器；

一个或多个处理器；

一个或多个程序，其中所述一个或多个程序存储在所述存储器中并被配置为由所述一个或多个处理器执行，所述一个或多个程序包括用于执行根据权利要求1-8所述方法中的任一方法的指令。

10.一种存储一个或多个程序的计算机可读存储介质，所述一个或多个程序包括指令，所述指令当计算设备执行时，使得所述计算设备执行根据权利要求1-8所述的方法中的任一方法。