[发明专利]绿豆叶斑病抗性基因VrTAF5的两个PARMS-SNP分子标记

权利要求书

1.一种用于检测绿豆叶斑病抗性基因VrTAF5的两个PARMS-SNP分子标记的引物组在辅助筛选绿豆叶斑病抗性品种中的应用，其特征在于，所述两个PARMS-SNP分子标记包括SNP位点PARMS-1517和PARMS-10010；

所述PARMS-1517前后共240bp的序列如SEQ ID NO.1所示，第131位即为SNP位点，多态性为A/C；所述PARMS-10010前后共240bp的序列如SEQ ID NO.2所示，第117位即为SNP位点，多态性为A/G；

所述引物组包括PARMS-1517引物组和PARMS-10010引物组；

其中，所述PARMS-1517引物组包括引物PARMS-1517F1、PARMS-1517F2和PARMS-1517R：PARMS-1517F1的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，PARMS-1517F2的核苷酸序列如SEQ IDNO.4所示，所述PARMS-1517R的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示；所述PARMS-10010引物组包括引物PARMS-10010F1、PARMS-10010F2和PARMS-10010R；所述PARMS-10010F1的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示，所述PARMS-10010F2的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示，所述PARMS-10010R的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示。

2.两个PARMS-SNP分子标记的引物组在检测绿豆叶斑病抗性基因VrTAF5中的应用，其特征在于，所述两个PARMS-SNP分子标记包括SNP位点PARMS-1517和PARMS-10010；

所述PARMS-1517前后共240bp的序列如SEQ ID NO.1所示，第131位即为SNP位点，多态性为A/C；所述PARMS-10010前后共240bp的序列如SEQ ID NO.2所示，第117位即为SNP位点，多态性为A/G；

所述引物组包括PARMS-1517引物组和PARMS-10010引物组；

其中，所述PARMS-1517引物组包括引物PARMS-1517F1、PARMS-1517F2和PARMS-1517R：PARMS-1517F1的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，PARMS-1517F2的核苷酸序列如SEQ IDNO.4所示，所述PARMS-1517R的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示；所述PARMS-10010引物组包括引物PARMS-10010F1、PARMS-10010F2和PARMS-10010R；所述PARMS-10010F1的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示，所述PARMS-10010F2的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示，所述PARMS-10010R的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示。

3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述检测绿豆叶斑病抗性基因VrTAF5的具体步骤为：利用所述引物组对绿豆基因组DNA进行PCR扩增，PCR扩增完成后读取荧光信号，解析转换荧光信号，鉴定基因型，即鉴定出属于感病纯合AA型基因型，抗病纯合CC或GG型基因型、杂合CA或AG基因型。

4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述PARMS-1517引物组的PCR扩增反应体系为：1μL模板DNA、5μL的2×PARMS master mix、0.15μL 10μM的引物PARMS-1517F1、0.15μL10μM的引物PARMS-1517F2、0.4μL 10μM的引物PARMS-1517R和3.3μL ddH₂O；

所述PARMS-10010引物组的PCR扩增反应体系为：1μL模板DNA、5μL的2×PARMS mastermix、0.15μL 10μM的引物PARMS-10010F1、0.15μL 10μM的引物PARMS-10010F2、0.4μL 10μM的引物PARMS-10010R和3.3μL ddH₂O。