[发明专利]一种基于DNA损伤修复缺陷活细胞彗星检测水体中有机污染物毒性的方法有效
申请号: | 202110081875.9 | 申请日: | 2021-01-21 |
公开(公告)号: | CN112782144B | 公开(公告)日: | 2022-06-03 |
发明(设计)人: | 曾志红;刘敏卓;刘芳;陈建荣;陈珺;阳宗欣 | 申请(专利权)人: | 长沙学院 |
主分类号: | G01N21/64 | 分类号: | G01N21/64;G01N27/447;C12Q1/02 |
代理公司: | 长沙朕扬知识产权代理事务所(普通合伙) 43213 | 代理人: | 郭蓓霏 |
地址: | 410022 湖*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 dna 损伤 修复 缺陷 细胞 彗星 检测 水体 有机 污染物 毒性 方法 | ||
1.一种基于DNA损伤修复缺陷活细胞彗星检测水体中有机污染物毒性的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)采集水样富集物,将所述水样富集物处理DNA 损伤修复缺陷活细胞,同时以所述水样富集物处理的DNA 损伤修复正常活细胞作为对照;将上述处理的DNA损伤修复缺陷活细胞和正常活细胞分别离心沉淀,再用PBS重新悬浮细胞,离心得到第一细胞悬液,备用;
所述DNA损伤修复缺陷活细胞由鸡B淋巴细胞DT40敲除DNA修复基因TDP1和/或TDP2后得到;所述DNA损伤修复缺陷活细胞为TDP1 KO细胞系或TPD2 KO细胞系,所述TDP1 KO细胞系由鸡B淋巴细胞DT40敲除TDP1基因上如SEQ ID NO:1所示的基因片段后得到,所述TPD2KO细胞系由鸡B淋巴细胞DT40敲除TDP2基因上如SEQ ID NO:2所示的基因片段后得到;
(2)将所述步骤(1)处理后得到的第一细胞悬液制备成彗星电泳载玻片细胞样品;
(3)将所述步骤(2)后得到的彗星电泳载玻片细胞样品去掉盖玻片,浸入碱性裂解液中进行细胞裂解,然后取出裂解后的载玻片,放入电泳槽电泳,电泳结束后将载玻片细胞样品进行中和处理;
(4)中和完毕后在载玻片细胞样品上滴加DNA荧光染料,加盖盖玻片,用荧光显微镜观察慧星变化,测量经过所述水样富集物处理的DNA损伤修复缺陷活细胞和正常活细胞的慧星尾矩值,得到DNA慧星迁移尾矩值。
2. 根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(1)中,采集水样富集物的方法,具体包括如下步骤:采集水样,静置一段时间后,过滤去除悬浮颗粒,通过大孔树脂吸附柱富集,再用氮气去除水分,依次用甲醇、丙酮和二氯甲烷洗脱,得到的洗脱液进行浓缩、吹干,最后用二甲基亚砜溶解,得水样富集物;所述第一细胞悬液的细胞浓度为 0.5-1.0x105个细胞/mL。
3. 根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述大孔树脂为XAD-2、XAD-4、XAD-7、XAD-8或XAD-2/XAD-8 树脂;所述静置的时间为24-36h;所述浓缩的温度为45-50℃;所述水样富集物在-18℃至-70℃下避光保存备用。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(2)中,所述彗星电泳载玻片细胞样品的制备方法,具体包括如下步骤:将正常熔点琼脂糖铺滴在磨砂载玻片上,迅速盖上盖玻片,进行固化,得到第一层胶;向步骤(1)处理后得到的第一细胞悬液中加入等体积的低熔点琼脂糖溶液,吹打均匀形成第二细胞悬液,取第二细胞悬液铺滴至所述第一层胶上,盖上盖玻片,进行固化,得到第二层细胞胶,完成彗星电泳载玻片细胞样品的制备。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述正常熔点琼脂糖的熔点为大于90℃,其质量浓度为0.6%;所述低熔点琼脂糖的熔点为42-65℃,其溶液质量浓度为1.2%;固化温度为0-4℃,固化时间为30~120min。
6. 根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(3)中,所述碱性裂解液包括0.5M EDTA和5M NaCL,碱性裂解液pH=13,用前加入体积浓度1%的Triton X-100和体积浓度1%的二甲基亚砜;所述碱性裂解液的温度为4℃,细胞裂解温度为4℃,裂解时间为10~120min。
7. 根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(3)中,所述电泳的具体操作包括如下步骤:向电泳槽中注入pH=13.0的碱性电泳液,静置30-45 min后开始电泳,电流为200~300 mA,电压为12~25 V,电泳时间为20~30 min;电泳结束后将载玻片置于Tris-HCL缓冲液中进行中和漂洗5-10分钟,所述Tris-HCL缓冲液的浓度为0.4 M,漂洗次数为3次,每次漂洗时间为15min。
8. 根据权利要求1-7中任一项所述的方法,其特征在于,所述步骤(4)中,所述DNA荧光染料为1xSYBR Green I 溶液,用荧光显微镜观察彗星,获取彗星图像后,用CASP软件分测量经过所述水样富集物处理的DNA损伤修复缺陷活细胞和正常活细胞的慧星尾矩值,得到DNA慧星迁移尾矩值。
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