[发明专利]用于检测拉蒂诺病毒、莫巴拉病毒和莫佩亚病毒的引物探针、靶标组合、试剂盒和方法有效
申请号: | 202110096385.6 | 申请日: | 2021-01-25 |
公开(公告)号: | CN112662817B | 公开(公告)日: | 2022-07-08 |
发明(设计)人: | 李建东;杜珊珊;李阿茜;梁米芳;李德新;王世文;黄晓霞;李川;王芹;孙丽娜;芜为 | 申请(专利权)人: | 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 孙怡 |
地址: | 102206 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 拉蒂诺 病毒 莫巴拉 莫佩亚 引物 探针 靶标 组合 试剂盒 方法 | ||
1.用于检测拉蒂诺病毒、莫巴拉病毒和莫佩亚病毒的引物探针组合,其特征在于,含有三对特异性引物和三条特异性探针,其中,所述特异性引物的序列如SEQ ID NO.1-6所示,所述特异性探针的序列如SEQ ID NO.7-9所示。
2.根据权利要求1所述的引物探针组合,其特征在于,所述特异性探针分别标记产生不同荧光色的荧光基团,所述荧光基团包括荧光报告基团和荧光猝灭基团;
所述荧光报告基团为选自FAM、HEX、Texas Red、CY5、TET、JOE、CY3、TAMRA、ROX、LCRED640、LC RED705中的任一种;所述荧光猝灭基团为选自BHQ1、BHQ2、BHQ3、Dabcyl中的任一种。
3.根据权利要求1或2所述的引物探针组合,其特征在于,序列如SEQ ID NO.7所示的特异性探针的5’端标记FAM荧光报告基团,3’端标记BHQ1荧光淬灭基团;序列如SEQ ID NO.8所示的特异性探针的5’端标记HEX荧光报告基团,3’端标记BHQ1荧光淬灭基团;序列如SEQID NO.9所示的特异性探针的5’端标记Texas Red荧光报告基团,3’端标记BHQ2荧光淬灭基团。
4.用于检测拉蒂诺病毒、莫巴拉病毒和莫佩亚病毒的病毒基因组保守区靶标组合,其特征在于,含有三条靶标,其中,靶标的序列如SEQ ID NO.10-12所示。
5.权利要求1~3任一项所述的引物探针组合或权利要求4所述的病毒基因组保守区靶标组合在制备用于检测拉蒂诺病毒、莫巴拉病毒和莫佩亚病毒的试剂盒中的应用。
6.用于拉蒂诺病毒、莫巴拉病毒和莫佩亚病毒单独或同时检测的试剂盒,其特征在于,包含权利要求1~3任一项所述的引物探针组合,和/或,权利要求4所述的病毒基因组保守区靶标组合。
7.根据权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒进行实时荧光定量RT-PCR检测时的反应程序为:50℃逆转录30min;95℃预变性10min,95℃变性15s、60℃退火60s,运行40个循环。
8.根据权利要求6或7所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒在进行实时荧光定量RT-PCR检测时,每25μL反应体系为:2×缓冲液12.5μL,10μM上游引物0.5μL,10μM下游引物0.5μL,10μM探针0.25μL,酶1μL,模板5μL,用无RNA水解酶的纯净水补足至25μL。
9.一种非疾病诊断目的利用实时荧光定量RT-PCR分别检测拉蒂诺病毒、莫巴拉病毒和莫佩亚病毒的方法,其特征在于,以待测样品的RNA为检测模板,利用如SEQ ID NO.1-6所示的特异性引物和如SEQ ID NO.7-9所示的特异性探针进行实时荧光定量RT-PCR检测,根据扩增曲线判断待测样品中是否含有相应病毒。
10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于,所述实时荧光定量RT-PCR的反应程序为:50℃逆转录30min;95℃预变性10min,95℃变性15s、60℃退火60s,运行40个循环;
所述实时荧光定量RT-PCR的每25μL反应体系为:2×缓冲液12.5μL,10μM上游引物0.5μL,10μM下游引物0.5μL,10μM探针0.25μL,酶1μL,模板5μL,RNase Free Water补足至25μL。
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