[发明专利]与鸡开产日龄和产蛋量相关的HSD3B1基因SNP分子标记及应用

说明书

与鸡开产日龄和产蛋量性状相关的SNP分子标记及应用，属于遗传学技术领域，所述SNP分子标记来自HSD3B1基因，核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，在SEQ ID NO.1所示序列自第5’端第274位碱基C突变成了T(即NCBI HSD3B1mRNA序列NM_205118.1上的274(CT))。本发明首次发现了鸡HSD3B1基因Exon 3存在1个突变位点，即C274T，CC基因型的个体开产日龄早于其他基因型，选择CC基因型个体用于留种，可提高鸡群整体生产性能。可见检测这一个与产蛋性状相关联的分子标记，不仅方法简便快捷，且有利于选育高产蛋鸡品种，加快育种进程。

技术领域

本发明属于遗传学技术领域，涉及一种鸡HSD3B1基因第274位点单个突变位点分子标记方法及其在鸡育种中的应用，具体为与鸡开产日龄和产蛋量性状相关的SNP分子标记及应用。

背景技术

3β-羟基类固醇脱氢酶-1(3β-hydroxysteroid dehydrogenase 1,HSD3B1)是类固醇激素家族中的关键成员之一，是类固醇激素合成过程中至关重要的酶，它主要催化△5-3β-羟基类固醇(孕烯醇酮、17-羟孕烯醇酮、去氢表雄酮和雄烯二醇)脱氢转变为△4-3-酮基类固醇(孕酮、17-羟孕酮、雄烯二酮和睾酮)，经过这种脱氢化反应后,类固醇由没有活性或者活性较低转化为活性很高的类固醇激素，类固醇激素是动物体内最主要的一类性腺激素。参与动物的生殖调控，与动物的繁殖性状密切相关。3β-HSD家族基因成员数在各种动物之间差异较大，在家禽上面仅发现HSD3B1基因，Sechman等(2016)研究表明HSD3B1与鸡(Gallus gallus)卵巢分泌类固醇激素有关，从而影响鸡的卵泡发育及排卵。杨明军(2012)对鹅(Anseris ae-quabis)的HSD3B1基因CDS区克隆并检测到HSD3B1基因在鹅卵巢组织表达量最高，且mRNA表达水平会随着卵泡发育大小发生波动。田志龙(2019)通过qRT-PCR检测了HSD3B1基因在不同产羔性状的苏尼特羊(Capra hircus)和小尾寒羊(C.hircus)组织中的表达量，发现其在卵巢组织特异性表达，推测该基因与卵巢功能密切相关。HSD3B1基因参与卵巢类固醇激素的合成、吸收和释放，对卵泡的生长发育和排卵发挥着重要的生物学功能。

分子标记辅助选择育种，是利用分子标记与控制目标性状基因紧密连锁的特点，在DNA分子水平上，快速准确筛选优势基因型，缩短育种年限，加快育种进程，提高育种效率。因此，研究鸡HSD3B1基因SNPs，有助于找到有意义的分子标记，为鸡产蛋性的标记辅助选择奠定理论基础，同时为提高鸡繁殖率提供新思路。

发明内容

针对上述现有技术，本发明的目的是提供一种鸡HSD3B1基因Exon区单个突变位点分子标记方法及其在鸡育种中的应用。

为实现其目的采用的技术方案是：

与鸡开产日龄和产蛋量性状相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记来自HSD3B1基因，核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，在SEQ ID NO.1所示序列自第5’端第94位碱基C突变成了T(即NCBI HSD3B1 mRNA序列NM_205118.1上的第274位点(CT))。

与鸡开产日龄和产蛋量性状相关的SNP分子标记，HSD3B1基因第274位点碱基为C的个体表现开产早性状。

所述的鸡开产日龄和产蛋量性状相关的SNP分子标记在鸡遗传育种中的应用。应用于高产蛋鸡品种的选育和/或早开产日龄蛋鸡的选育。

一种检测与鸡开产日龄和产蛋量性状相关的SNP分子标记的PCR引物，采用标记引物P-HSD3B1，包括：

P-HSD3B1F：5'GCCCAAGGTGTCAATGAT 3'；

P-HSD3B1R：5'AAGACCCTCTGTGCCATT 3'。

所述引物在辅助选育高产蛋鸡品种的选育和/或早开产日龄蛋鸡品种中的应用。