[发明专利]一种用于鉴定玉米穗行数的InDel分子标记及其应用在审
申请号: | 202110109521.0 | 申请日: | 2021-01-25 |
公开(公告)号: | CN112695123A | 公开(公告)日: | 2021-04-23 |
发明(设计)人: | 王天宇;安怡昕;李永祥;张登峰;李春辉;刘旭洋;宋燕春;石云素;黎裕 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院作物科学研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
地址: | 100081 北京市海淀区中关*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 鉴定 玉米 行数 indel 分子 标记 及其 应用 | ||
1.玉米穗行数InDel分子标记或检测所述玉米穗行数InDel分子标记的物质在鉴定或辅助鉴定玉米穗行数中的应用,其特征在于,所述玉米穗行数InDel分子标记是核苷酸序列如SEQ ID No.1所示的DNA分子。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述检测所述玉米穗行数InDel分子标记的物质含有扩增包含所述玉米穗行数InDel分子标记在内的玉米基因组DNA片段的PCR引物。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述PCR引物为引物对,所述引物对由正向引物和反向引物组成,所述正向引物为与玉米基因组DNA中SEQ ID No.1所示双链DNA的上游特异结合的单链DNA,所述反向引物为与玉米基因组DNA中SEQ IDNo.1所示双链DNA的下游特异结合的单链DNA。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述正向引物序列如SEQ ID No.2所示,所述反向引物序列如SEQ ID No.3所示。
5.根据权利要求1-4中任一所述的应用,其特征在于,所述玉米为玉米自交系。
6.一种鉴定或辅助鉴定玉米穗行数的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)以待鉴定玉米基因组DNA为模板,利用权利要求3或4所述引物对进行PCR扩增,得到PCR产物;
(2)根据所述PCR产物是否含有权利要求1中所述的玉米穗行数InDel分子标记来鉴定玉米穗行数:
所述PCR产物含有权利要求1中所述的玉米穗行数InDel分子标记的所述待鉴定玉米的穗行数高于所述PCR产物不含有权利要求1中所述的玉米穗行数InDel分子标记的所述待鉴定玉米。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述待鉴定玉米为玉米自交系。
8.根据权利要求6或7所述的方法,其特征在于,所述PCR的扩增程序为:95℃预变性3min;95℃变性15s,57℃退火25s,72℃延伸1min,34个循环;72℃延伸5min。
9.权利要求1中所述的玉米穗行数InDel分子标记。
10.权利要求1中所述的玉米穗行数InDel分子标记或权利要求2-4中任一所述的引物在玉米种质资源分析或分子标记辅助育种中的应用。
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