[发明专利]一种直接扩增检测口腔肿瘤基因生存相关的引物组、试剂盒及其方法在审
申请号: | 202110115508.6 | 申请日: | 2021-01-28 |
公开(公告)号: | CN112662779A | 公开(公告)日: | 2021-04-16 |
发明(设计)人: | 王丹玲;江勇;郭成贤 | 申请(专利权)人: | 长沙深宇生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6851;C12N15/11 |
代理公司: | 长沙中科启明知识产权代理事务所(普通合伙) 43226 | 代理人: | 谭勇 |
地址: | 410013 湖南省长沙市高新开发*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 直接 扩增 检测 口腔 肿瘤 基因 生存 相关 引物 试剂盒 及其 方法 | ||
1.一种同时扩增多个基因的引物组,其特征在于:所述引物组最少包括两组引物的核苷酸序列,所述的两组引物的核苷酸序列的分别如下所述:前引物为:5’-ctgggattacaggtgtgtcccaccatgcccagctaat-3’和后引物:5’-ggcctcccagagggctaggattataggtgt-3’,所述多个基因为eIF3A基因组。
2.一种直接扩增检测口腔肿瘤基因生存相关的试剂盒,其特征在于:包括如权利要求1所述的引物组,还包括Buffer PKD、蛋白酶K和Buffer RPE。
3.一种直接扩增检测口腔肿瘤基因生存相关的检测方法,其特征在于:使用了权利要求2的试剂盒。
4.根据权利要求3所述的一种直接扩增检测口腔肿瘤基因生存相关的检测方法,其特征在于:所述方法使用了PRC扩增,所述检测样品为刮取石蜡组织标本或者新鲜组织标本,包括以下步骤:
S1:将检测样品切片放入1.5ml离心管中,加1ml二甲苯,涡旋10秒,然后在20-25℃条件下,以132000rpm离心2分钟;
S2:吸弃上清液,往沉淀中加入1ml无水乙醇,涡旋混匀,132000rpm,20-25℃离心2分钟,再吸弃上清液,打开管盖,室温10分钟,使乙醇挥发干净;S3:加入150ul Buffer PKD,10ul蛋白酶K,重悬沉淀,涡旋混匀,分别55℃,15分钟;80℃,15分钟;
S4:加入320ul Buffer RBC,充分混匀,转移至含2ml收集管的gDNA结合柱,13000rpm,离心30秒,保留流出液;
S5:向流出液中加入720ul无水乙醇,反复吹打混匀,将700ul样品转移至含2ml收集管进行Rneasy MinElute spin colum,13000rpm,离心15秒,舍弃流出液,重复操作直至所有的样品gDNA结合柱;
S6:向RNA结合柱中加入500ul Buffer RPE,盖上管盖,13000rpm,离心15秒,洗膜,摒弃流出液;向RNA结合柱中加入500ul Buffer RPE,盖上管盖,13000rpm,离心2分钟,洗膜,弃流出液;将Rneasy MinElute spin colum放入干净的1.5ml收集管中,直接将20ul RNase-free水加至膜上,盖上管盖,13200rpm,离心1分钟,洗脱RNA;
S7:进行RNA的逆转录,11ul RNA模板,加1ul随机引物,混匀,将液体离心至管底,放入PCR仪,65℃,5分钟;
S8:基于S7,在实验过程中加液,依次加入:5xreaction buffer 4μL;RNase inhibitor(20u/ul)1μL;10mM dNTP Mix 2μL;M-MuLV Reverse Transcriptase(200u/ul)1μL;Totalvolume per reaction 8μL,分成四组,分别为25℃,5分钟;42℃,60分钟;70℃,5分钟;4℃,5分钟;
S9:进行RNA的定量化,包括:将cDNA稀释10倍,取2ulcDNA稀释,加18ul ddH2O,配置Mix:ddH2O 7μL,2x Quantitative Reaction Mix 10μL,RRM1/ACTB Forward and Reverseprimer 0.5μL+0.5ul,Total volume per reaction18ul,再将反应液加入PCR反应管进行检测。
5.权利要求4所述的一种直接扩增检测口腔肿瘤基因生存相关的检测方法,其特征在于:所述反应液加入PCR反应管进行检测的步骤包括:PCR预变性程序和PCR扩增溶解反应程序,所述PCR预变性程序为95℃,5min;PCR扩增溶解反应程序为:95℃,10s,循环40次;60℃,15s,循环40次;72℃,20s,循环40次,再应用分析软件,给出CP(CT)值,根据计算公式得出基因的相对表达量E。
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