[发明专利]一种鼻咽癌单细胞检测方法、存储介质及系统有效
申请号: | 202110120055.6 | 申请日: | 2021-01-28 |
公开(公告)号: | CN113267482B | 公开(公告)日: | 2023-07-25 |
发明(设计)人: | 熊丹;张秀明;武薇;豆小文;陈大洋 | 申请(专利权)人: | 深圳市罗湖区人民医院 |
主分类号: | G01N21/65 | 分类号: | G01N21/65 |
代理公司: | 深圳市君胜知识产权代理事务所(普通合伙) 44268 | 代理人: | 徐凯凯 |
地址: | 518000 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鼻咽癌 单细胞 检测 方法 存储 介质 系统 | ||
本发明公开了一种鼻咽癌单细胞检测方法、存储介质及系统,方法包括步骤:通过单细胞拉曼显微光谱技术获取鼻咽癌样本和鼻咽正常样品的拉曼光谱,然后基于所述拉曼光谱构建SVM模型的检测函数SVM_Model,最后基于构建的所述检测函数SVM_Model对待检样品的拉曼光谱进行检测并输出检测结果,从而判断待检测样本是否含有鼻咽癌单细胞。本发明提供的方法具有快捷、高效、准确、无标记、非侵入性等优点。
技术领域
本发明涉及细胞检测制备领域,特别涉及一种鼻咽癌单细胞检测方法、存储介质及系统。
背景技术
早期鼻咽癌对放化疗敏感,生存率可达90%,但由于鼻咽癌发病隐匿,大部分患者确诊时处于中晚期,转移和复发风险显著提高。因此开发灵敏准确的鼻咽癌早期无创检测技术对鼻咽癌的防治、治疗及预后评估意义重大。
目前,鼻咽癌的临床检测手段主要包括:1.EBV病原体检测:包括EBV-DNA和EBV编码的miRNA及EBV血清学抗体检测,是目前临床使用的最广泛成熟的诊断和预后判断生物标志物,但仅针对非角化型鼻咽癌患者,且敏感度欠缺和特异度均不理想。2.影像学检测:包括CT、MRI、PET/CT等,在晚期鼻咽癌预后判断中具有良好的性能,非侵入性,但特征性表现晚。3.鼻腔镜活检结合病理组织分期:是目前诊断鼻咽癌的金标准,但是病理学检查具有侵袭性,检测依赖于病理医师的经验判断,具有一定的主观性,难以对早期肿瘤或微小病灶作出准确诊断。以上手段对鼻咽癌的快速、敏感、无创、准确、早期诊断均存在一定的局限性。
因此,现有技术还有待于改进和发展。
发明内容
本发明要解决的技术问题在于,针对现有技术的不足,提供一种鼻咽癌单细胞检测方法、存储介质及系统,旨在解决现有鼻咽癌细胞检测方法存在侵袭性大以及准确性差的问题。
为了解决上述技术问题,本发明所采用的技术方案如下:
一种鼻咽癌单细胞检测方法,其中,包括步骤:
获取鼻咽癌样品和正常鼻咽样品的拉曼光谱;
对所述拉曼光谱进行去背景和面积归一化处理,得到标准化光谱数据;
将由鼻咽癌样品和正常鼻咽样品组成的数据集按预定比例分成两份,分别作为训练集和测试集;
对所述训练集和测试集均进行PCA分析,选取累计贡献率大于90%时的主成分个数为m个,其中mn,定义主因子为S1、S2、……、Sm,则
S1=aX1+bX2+……+cXn
S2=dX1+eX2+……+fXn
Sm=gX1+hX2+……+iXn,其中X1、X2、……、Xn为标准化光谱数据;
采用经过PCA分析的所述训练集建立SVM模型的检测函数SVM_Model,将经过PCA分析的所述测试集输入SVM_Model中,预测样本类型,并与金标准进行比较分析,得到特异性、灵敏度及准确度;
将待检样品的检测变量X1、X2、……、Xn经PCA转换成S1、S2、……、Sm后输入所述SVM_Model中,输出结果。
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