[发明专利]单增李斯特菌的微滴数字PCR检测方法及其应用在审
申请号: | 202110139496.0 | 申请日: | 2021-02-01 |
公开(公告)号: | CN112680535A | 公开(公告)日: | 2021-04-20 |
发明(设计)人: | 张红星;谢远红;章若曦;张帅;金君华;刘慧;刘文博 | 申请(专利权)人: | 北京农学院 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6851;C12Q1/06;C12R1/01 |
代理公司: | 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) 11463 | 代理人: | 陈露 |
地址: | 102200 北京市*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 李斯特 数字 pcr 检测 方法 及其 应用 | ||
1.一种单增李斯特菌的微滴数字PCR检测方法,其特征在于,包括以下步骤:分别提取单增李斯特菌标准品、待测样品和非目标菌株的DNA,然后将得到的DNA进行微滴数字PCR扩增得到反应液,最后对反应液进行检测和分析;
所述微滴数字PCR扩增的引物具有如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列;
所述微滴数字PCR扩增的探针具有如SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列。
2.根据权利要求1所述的单增李斯特菌的微滴数字PCR检测方法,其特征在于,所述单增李斯特菌标准品包括质粒;
优选地,所述质粒包括单增李斯特菌被所述引物所扩增的序列。
3.根据权利要求1所述的单增李斯特菌的微滴数字PCR检测方法,其特征在于,所述非目标菌株包括金黄色葡萄球菌、铜绿芽孢杆菌、沙门氏菌或大肠杆菌中的至少一种。
4.根据权利要求1所述的单增李斯特菌的微滴数字PCR检测方法,其特征在于,所述微滴数字PCR的反应体系包括:ddPCR Supermix for Probes 9-11μL、上游引物1.8-2.2μL、下游引物1.8-2.2μL、探针0.9-1.1μL、模板DNA 0.9-1.1μL和双蒸水3.6-4.4μL;
优选地,所述微滴数字PCR的反应体系包括:ddPCR Supermix for Probes 10μL、上游引物2μL、下游引物2μL、探针1μL、模板DNA 1μL和双蒸水4μL。
5.根据权利要求4所述的单增李斯特菌的微滴数字PCR检测方法,其特征在于,所述反应体系中,上游引物、下游引物和探针的浓度各自独立地为90-110μmol/L,优选为100μmol/L。
6.根据权利要求1所述的单增李斯特菌的微滴数字PCR检测方法,其特征在于,所述微滴数字PCR的反应条件为:预变性:94-95℃,3-10min,1个循环;变性:94-95℃,30-40s,退火:50-58℃,60-80s,40个循环;结束反应:4-6℃,4-6min,88-90℃,4-6min,1个循环;控温速率1.9-2.1℃/s;
优选地,所述微滴数字PCR的反应条件为:预变性:95℃,5min,1个循环;变性:95℃,30s,退火:55.7℃,60s,40个循环;结束反应:4℃,5min,90℃,5min,1个循环;控温速率2℃/s。
7.根据权利要求1所述的单增李斯特菌的微滴数字PCR检测方法,其特征在于,所述探针的两端分别含有荧光淬灭基团和荧光报告基团。
8.根据权利要求7所述的单增李斯特菌的微滴数字PCR检测方法,其特征在于,所述荧光报告基团包括FAM、CY5或HEX,优选为FAM。
9.根据权利要求7所述的单增李斯特菌的微滴数字PCR检测方法,其特征在于,所述荧光报告基团包括BHQ1或BHQ2,优选为BHQ1。
10.权利要求1-9任一项所述的单增李斯特菌的微滴数字PCR检测方法在食品检测中的应用。
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