[发明专利]基于CRISPR-Cas14a的通用细菌和病毒检测系统、方法及应用在审
申请号: | 202110142160.X | 申请日: | 2021-05-24 |
公开(公告)号: | CN113186258A | 公开(公告)日: | 2021-07-30 |
发明(设计)人: | 宋凤阁;崔倩;杨治庆 | 申请(专利权)人: | 海南微氪生物科技股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844;C12Q1/689;C12Q1/70 |
代理公司: | 海口翔翔专利事务有限公司 46001 | 代理人: | 莫臻 |
地址: | 570000 海南省海口市南海大道266*** | 国省代码: | 海南;46 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 crispr cas14a 通用 细菌 病毒 检测 系统 方法 应用 | ||
1.基于CRISPR-Cas14a的通用细菌和病毒检测系统,其特征在于,包括CRISPR-Cas14a系统、TSPE和磁性纳米粒子;
所述CRISPR-Cas14a系统包括通用sgRNA和Cas14a;
所述TSPE为标签特异性引物扩增体系,包括含有Tag序列的标签正向引物和含有生物素标记序列的反向引物;
所述磁性纳米粒子可与TSPE的反向引物连接。
2.根据权利要求1所述的基于CRISPR-Cas14a的通用细菌和病毒检测系统,其特征在于,所述通用sgRNA序列如SEQ ID NO.1所示。
3.根据权利要求1所述的基于CRISPR-Cas14a的通用细菌和病毒检测系统,其特征在于,所述CRISPR-Cas14a系统还包括探针DNA,
所述探针DNA修饰有荧光基团和猝灭基团。
4.根据权利要求1所述的基于CRISPR-Cas14a的通用细菌和病毒检测系统,其特征在于,所述TSPE还包括目标DNA模板。
5.根据权利要求1所述的基于CRISPR-Cas14a的通用细菌和病毒检测系统,其特征在于,所述磁性纳米粒子为链霉亲和素磁珠。
6.基于CRISPR-Cas14a的通用细菌和病毒检测方法,其特征在于,所述检测方法包括以下步骤:
(1)将待测样的DNA作为模板,利用DreamTaqTM热启动DNA聚合酶以及目标DNA的标签正向引物、反向引物进行PCR扩增,制备得到TSPE产品;
(2)将TSPE产品与磁性纳米粒子混合,富集,得到磁珠复合物;
(3)利用权利要求1-5所述的通用细菌和病毒检测系统检测磁珠复合物。
7.根据权利要求6所述的基于CRISPR-Cas14a的通用细菌和病毒检测方法,其特征在于,所述富集操作包括以下操作:
将TSPE与磁性纳米粒子的混合液室温下搅拌,并用PBS洗涤,通过磁分离获得磁珠复合物。
8.根据权利要求6所述的基于CRISPR-Cas14a的通用细菌和病毒检测方法,其特征在于,还包括:sgRNA的预制备和Cas14a的纯化。
9.一种根据权利要求1-5任一项所述的检测系统在检测无PAM序列DNA中的应用。
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