[发明专利]建库方法及应用在审

专利信息
申请号: 202110148830.9 申请日: 2021-02-03
公开(公告)号: CN114854824A 公开(公告)日: 2022-08-05
发明(设计)人: 陈俊清 申请(专利权)人: 深圳华大基因股份有限公司
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806;C12Q1/6869;C40B50/06;C40B40/06
代理公司: 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 代理人: 李岩
地址: 518083 广东省深圳市盐田*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 方法 应用
【权利要求书】:

1.一种建库方法,其特征在于,包括:

(1)针对石蜡包埋后的生物样本,进行裂解处理,并利用沉淀法从所述裂解处理得到的裂解液收集核酸样本,以便得到浓缩核酸,其中,所述核酸样本中含有长度不大于200bp的核酸片段;

(2)对所述浓缩核酸进行末端修复及加入接头,以便获得连接有接头的核酸样本;和

(3)对所述连接有接头的核酸样本进行扩增处理,以便获得扩增产物,所述扩增产物构成测序文库。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述生物样本被石蜡包埋不少于1年,并且所述裂解液中核酸的含量不超过100ng。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,利用沉淀法从所述裂解处理得到的裂解液收集核酸样本进一步包括:

(1-A)将所述裂解液与3M醋酸钠溶液、1微升20μg/μL的糖原和无水乙醇混合,其中,所述3M醋酸钠溶液与所述裂解液的体积比(0.1~0.2):1,所述无水乙醇与所述裂解液的体积比为(2~3):1;

(1-B)将步骤(1-A)中得到的溶液置于-10℃~-30℃不少于30分钟;和

(1-C)将步骤(1-B)中得到的溶液进行离心以便获得所述核酸样本。

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述核酸样本为RNA,并且在步骤(2)之前,进一步包括:

(1-1)将所述核酸样本进行反转录处理,以便获得含有DNA的核酸溶液;和

(1-2)将所述含有DNA的核酸溶液与聚乙二醇混合后,将所得到的混合物进行磁珠纯化,其中,所述含有DNA的核酸溶液与聚乙二醇的体积比为1:(0.5~0.7)。

5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,在扩增处理之前和之后的至少之一,将含有核酸的样本与聚乙二醇混合后进行磁珠纯化,所述含有核酸的样本与聚乙二醇的体积比为1:(0.5~0.7)。

6.一种测序文库,其特征在于,是由权利要求1~5任一项所述的方法获得的,其中,所述测序文库中插入片段不大于200bp的核酸片段占样本总核酸的比例不小于70%。

7.一种测序方法,其特征在于,包括:

根据权利要求1~5任一项所述的方法,构建测序文库;

利用高通量测序技术对所述测序文库进行测序。

8.一种测序结果分析方法,其特征在于,包括:

根据权利要求7所述的方法,进行测序,以便获得由测序读段构成的测序结果;

从所述测序结果中,选择插入片段不小于50bp的测序读段,以便获得经过过滤的测序结果;

将所述经过过滤的测序结果与参考序列进行比对,以便获得分析结果。

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