[发明专利]建库方法及应用在审
申请号: | 202110148830.9 | 申请日: | 2021-02-03 |
公开(公告)号: | CN114854824A | 公开(公告)日: | 2022-08-05 |
发明(设计)人: | 陈俊清 | 申请(专利权)人: | 深圳华大基因股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12Q1/6869;C40B50/06;C40B40/06 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 李岩 |
地址: | 518083 广东省深圳市盐田*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 方法 应用 | ||
1.一种建库方法,其特征在于,包括:
(1)针对石蜡包埋后的生物样本,进行裂解处理,并利用沉淀法从所述裂解处理得到的裂解液收集核酸样本,以便得到浓缩核酸,其中,所述核酸样本中含有长度不大于200bp的核酸片段;
(2)对所述浓缩核酸进行末端修复及加入接头,以便获得连接有接头的核酸样本;和
(3)对所述连接有接头的核酸样本进行扩增处理,以便获得扩增产物,所述扩增产物构成测序文库。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述生物样本被石蜡包埋不少于1年,并且所述裂解液中核酸的含量不超过100ng。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,利用沉淀法从所述裂解处理得到的裂解液收集核酸样本进一步包括:
(1-A)将所述裂解液与3M醋酸钠溶液、1微升20μg/μL的糖原和无水乙醇混合,其中,所述3M醋酸钠溶液与所述裂解液的体积比(0.1~0.2):1,所述无水乙醇与所述裂解液的体积比为(2~3):1;
(1-B)将步骤(1-A)中得到的溶液置于-10℃~-30℃不少于30分钟;和
(1-C)将步骤(1-B)中得到的溶液进行离心以便获得所述核酸样本。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述核酸样本为RNA,并且在步骤(2)之前,进一步包括:
(1-1)将所述核酸样本进行反转录处理,以便获得含有DNA的核酸溶液;和
(1-2)将所述含有DNA的核酸溶液与聚乙二醇混合后,将所得到的混合物进行磁珠纯化,其中,所述含有DNA的核酸溶液与聚乙二醇的体积比为1:(0.5~0.7)。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,在扩增处理之前和之后的至少之一,将含有核酸的样本与聚乙二醇混合后进行磁珠纯化,所述含有核酸的样本与聚乙二醇的体积比为1:(0.5~0.7)。
6.一种测序文库,其特征在于,是由权利要求1~5任一项所述的方法获得的,其中,所述测序文库中插入片段不大于200bp的核酸片段占样本总核酸的比例不小于70%。
7.一种测序方法,其特征在于,包括:
根据权利要求1~5任一项所述的方法,构建测序文库;
利用高通量测序技术对所述测序文库进行测序。
8.一种测序结果分析方法,其特征在于,包括:
根据权利要求7所述的方法,进行测序,以便获得由测序读段构成的测序结果;
从所述测序结果中,选择插入片段不小于50bp的测序读段,以便获得经过过滤的测序结果;
将所述经过过滤的测序结果与参考序列进行比对,以便获得分析结果。
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