[发明专利]一组神经胶质瘤分子分型及预后标志物在审
申请号: | 202110150284.2 | 申请日: | 2021-02-03 |
公开(公告)号: | CN114854853A | 公开(公告)日: | 2022-08-05 |
发明(设计)人: | 刘春芳;马展 | 申请(专利权)人: | 复旦大学附属华山医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11;G01N33/574 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 200040 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一组 神经 胶质 分子 预后 标志 | ||
1.一组用于神经胶质瘤分子分型、恶性分级及病人生存期预测的肿瘤标志物,所述肿瘤标志物包括ACVR1、BAX、BCL10、BMP8B、CANT1、CDH10、CDH12、CDK11B、CTSA、CXCR4、GDF15、IFITM3、ITGA1、ITGA3、ITGA4、ITGA11、ITGB1、ITGB1BP1、ITGB2、ITGB3BP、JUN、JUNB、LIF、NRG3、POU5F1、PRDM1、ROR2、STAT3、WNT5A、GDF15等30个基因;所述基因组(mRNA、蛋白质)表达量的改变,用以对神经胶质瘤进行分子分型、药物筛选、恶性分级及病人总体生存期预测等;
S1:联合所述基因(两个及两个以上的任意组合)表达量改变,对神经胶质瘤进行分子分型、药物筛选、恶性分级及病人总体生存期预测等;
S2:单独利用上述基因中LIF、PRDM1、IFITM3、ACVR1、CXCR4、ITGB1、GDF15、BMP8B、NRG3、CDH10、CDH12、ITGA1、ITGA3、ITGA4、ITGA11、ITGB1BP1、ITGB2、ITGB3BP、JUN、CANT1、JUNB、CDK11B、BCL10等基因表达量改变,对神经胶质瘤进行分子分型、药物筛选、恶性分级及病人总体生存期预测等;
S3:所述基因(单个或任意组合)与其它指标(如:WHO病理分级、1p19q状态)相结合后,再对神经胶质瘤进行分子分型、药物筛选、恶性分级及病人总体生存期预测等。
2.权利要求1所述的用途,其特征在于,检测神经胶质瘤组织和/或体液(包括血液、尿液、脑脊液等)中,上述基因表达量的改变,作为预测神经胶质瘤分子分型、靶向治疗、恶性程度、病人生存期等的指标。
3.权利要求1所述的用途,其特征在于,所述检测基因表达产物包括:蛋白质和RNA;既包括肿瘤细胞中的,也包括各种原因进入体液中的游离的RNA、蛋白及外泌体中的RNA、蛋白,包括完整和片段(RNA、蛋白)。
4.权利要求1,2所述的用途,其特征在于,本发明所涉及的血液包括全血、血清、血浆、分离有核细胞、血液中的循环肿瘤细胞、血液中的外泌体等。
5.权利要求1,3所述的用途,其特征在于,所述的蛋白浓度检测包括直接提取病变脑组织蛋白经化学或免疫学方法进行检测分析,所述的RNA浓度检测包括直接提取病变脑组织RNA。
6.权利要求1,3,5所述的用途,其特征在于,所述基因的检测包括蛋白水平和RNA水平;检测方法涉及:免疫组化、免疫荧光、Western blot、ELISA、流式细胞术检测、免疫化学发光、胶体金、化学法检测、RT-PCR、荧光定量PCR、RNA Sequencing、RNA array等检测技术,但不仅限于这些技术等。
7.权利要求1所述的用途,其特征在于,可以直接检测上述基因表达的绝对量;也可以是和正常组织(包括癌旁组织)的比值,作为预测神经胶质瘤分子分型、恶性程度、靶向药物、病人生存期等的指标。
8.权利要求1、6所述的用途,其特征在于所述的RT-PCR检测上述基因的RNA产物,逆转录后,涉及到PCR包括:普通PCR、荧光定量PCR、巢式PCR、多重PCR、数字PCR、芯片微阵列等。
9.权利要求1所述的用途,其特征在于通过上述基因的组合应用形成肿瘤标志物矩阵(芯片)模式,以提高神经间质瘤分子分型、恶性分级及预后判断的效率。
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