[发明专利]一种真姬菇Finc-B-5菌种的SSR标记指纹图谱及其构建方法与应用有效
申请号: | 202110153273.X | 申请日: | 2021-02-03 |
公开(公告)号: | CN112760404B | 公开(公告)日: | 2023-05-26 |
发明(设计)人: | 王楠;刘玉;夏晓静;曹娜;李金鑫 | 申请(专利权)人: | 上海丰科生物科技股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645 |
代理公司: | 南京灿烂知识产权代理有限公司 32356 | 代理人: | 王江南 |
地址: | 201400 上海市奉*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 真姬菇 finc 菌种 ssr 标记 指纹 图谱 及其 构建 方法 应用 | ||
1.一种真姬菇Finc-B-5菌种的SSR标记的指纹图谱鉴定方法,其特征在于:所述指纹图谱由6个SSR标记位点组成,其对应的6对引物的具体序列如下:
HMSSR3 正向引物:GCGAAACCATATTCATGCGT;
反向引物:ATTACTTGTCGTCGGCAGGA;
HMSSR5 正向引物:CACACCTTACGAGGTGAGCA;
反向引物:TGTTTGATGTTAGCCGAACG;
HMSSR11 正向引物:GGAGTTTGAGTTGAGGCAGC;
反向引物:ATGAACCAGACCAAAGACCG;
HMSSR19 正向引物:GCTTCGGCATAACAATGTCC;
反向引物:TGATTTGGTGTTGATGGTGAG;
HMSSR31 正向引物:ACGACGCACCGTGGTTTAT;
反向引物:GTAGGGTAGCGGCATCGTT;
HMSSR47 正向引物:TCTCATGGAACGACCTGGAG;
反向引物:TCCAAATCCAGACTCTTCGC;
相应带型编号组合为:(1+2)/(9+12)/(1+9)/(3+5)/1/3;
其中,引物HMSSR3对应的带型编号为1+2,其中编号1对应的等位基因片段的条带大小为138~138.99bp,编号2对应的等位基因片段的条带大小为141~141.99bp;
引物HMSSR5对应的带型编号为9+12,其中编号9对应的等位基因片段的条带大小为207~207.99bp,编号12对应的等位基因片段的条带大小为237~237.99bp;
引物HMSSR11对应的带型编号为1+9,其中编号1对应的等位基因片段的条带大小为263~263.99bp,编号9对应的等位基因片段的条带大小为291~291.99bp;
引物HMSSR19对应的带型编号为3+5,其中编号3对应的等位基因片段的条带大小为122~122.99bp,编号5对应的等位基因片段的条带大小为132~132.99bp;
引物HMSSR31对应的带型编号为1,其对应的等位基因片段的条带大小为152~152.99bp;
引物HMSSR47对应的带型编号为3,其对应的等位基因片段的条带大小为144~144.99bp;
所述真姬菇Finc-B-5菌种的保藏编号为:CGMCC No.11203。
2.权利要求1所述的真姬菇Finc-B-5菌种的SSR标记的指纹图谱的应用,其特征在于:所述真姬菇Finc-B-5菌种的SSR标记的指纹图谱用于鉴定真姬菇Finc-B-5菌种的的特异性。
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