[发明专利]一种真姬菇Finc-B-3菌种的SSR标记指纹图谱及其构建方法与应用有效
| 申请号： | 202110153276.3 | 申请日： | 2021-02-03 |
| 公开（公告）号： | CN112708694B | 公开（公告）日： | 2023-02-28 |
| 发明（设计）人： | 张文宏;夏晓静;刘玉;阿依尼尕尔·买合木提;王富强 | 申请（专利权）人： | 上海丰科生物科技股份有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645 |
| 代理公司： | 南京灿烂知识产权代理有限公司 32356 | 代理人： | 王江南 |
| 地址： | 201400 上海市奉*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 真姬菇 finc 菌种 ssr 标记 指纹 图谱 及其 构建 方法 应用 | ||
1.一种真姬菇Finc-B-3菌种的SSR标记的指纹图谱鉴定方法，其特征在于：所述指纹图谱由6个SSR标记位点组成，其对应的6对引物的具体序列如下：
HMSSR5正向引物：CACACCTTACGAGGTGAGCA；
反向引物：TGTTTGATGTTAGCCGAACG；
HMSSR18正向引物：GAGGATTGAAGGGACTGTCG；
反向引物：CCTCATCCTCCGACTCTACG；
HMSSR22正向引物：TGCTGGTGAGTGAGTTGGAG；
反向引物：ACGGCGACATAATCTGCTCT；
HMSSR38正向引物：TCTTCTTGTTCGGCGGTATC；
反向引物：ATCCGGCACAGGTAAAGATG；
HMSSR47正向引物：TCTCATGGAACGACCTGGAG；
反向引物：TCCAAATCCAGACTCTTCGC；
HMSSR51正向引物：CACCCCCTCATCCTACACAT；
反向引物：TGGTCAGAAGAAACGTCGTG；
相应带型编号组合为：(7+12)/4/(1+2)/(1+5)/(2+3+6)/(2+3)；
其中，引物HMSSR5对应的带型编号为7+12，其中编号7对应的等位基因片段条带大小为199~199.99bp，编号12对应的条带大小为237~237.99bp；引物HMSSR18对应的带型编号为4，其对应的等位基因片段条带大小为262~262.99bp；引物HMSSR22对应的带型编号为1+2，其中编号1对应的等位基因片段条带大小为174~174.99bp，编号2对应的等位基因片段条带大小为177~177.99bp；引物HMSSR38对应的带型编号为1+5，其中编号1对应的等位基因片段条带大小为171~171.99bp，编号5对应的等位基因片段条带大小为179~179.99bp；引物HMSSR47对应的带型编号为2+3+6，其中编号2对应的等位基因片段条带大小为141~141.99bp，编号3对应的等位基因片段条带大小为144~144.99bp，编号6对应的等位基因片段条带大小为155~155.99bp；引物HMSSR51对应的带型编号为2+3，其中编号2对应的等位基因片段条带大小为185~185.99bp，编号3对应的等位基因片段条带大小为199~199.99bp；
所述真姬菇Finc-B-3菌种的保藏编号为CGMCCNo.11204。
2.权利要求1所述的真姬菇Finc-B-3菌种的SSR标记的指纹图谱的应用，其特征在于：所述真姬菇Finc-B-3菌种的SSR标记的指纹图谱用于鉴定真姬菇Finc-B-3菌种的特异等位变异，和/或鉴定真姬菇Finc-B-3菌种的特异性。
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