[发明专利]流式细胞仪数据的设门方法、系统、存储介质及电子设备有效

专利信息
申请号: 202110153854.3 申请日: 2021-02-04
公开(公告)号: CN112507991B 公开(公告)日: 2021-06-04
发明(设计)人: 王策;王启伟;陈忠祥;钟金凤;侯冲;张宸瑄;苏志明;赵文轩;吴云良 申请(专利权)人: 季华实验室
主分类号: G06K9/00 分类号: G06K9/00;G06K9/62;G06K9/34
代理公司: 佛山市海融科创知识产权代理事务所(普通合伙) 44377 代理人: 陈志超;黄家豪
地址: 528200 广东省*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 细胞 数据 方法 系统 存储 介质 电子设备
【权利要求书】:

1.一种流式细胞仪数据的设门方法,用于生成流式细胞仪数据的设门曲线,其特征在于,包括以下步骤:

S1、将原始数据标准化换算,并基于换算后的数据生成关于数据点分布的二值图像;

S2、在二值图像上,计算确定聚类中心的数目和位置;

S3、基于二值图像,获取聚类中心对应的轮廓边界并将该轮廓边界向外偏置,将偏置后的轮廓边界映射至原始数据中,生成初始设门曲线;

S4、以原始数据计算各数据点的局部密度以及数据点之间的距离,并根据局部密度和距离数值将所有数据点分配至以聚类中心为基准的对应聚类簇内;

S5、根据聚类簇内数据点的分配情况,生成分别归属于各聚类簇且彼此无交集的凸包轮廓;

S6、以凸包轮廓为边界,调整各聚类簇的初始设门曲线的边界,将调整后的初始设门曲线输出为最终设门曲线;

步骤S1包括以下子步骤:

S11、将原始数据通过离差标准化的方式映射至预设范围内形成标准化散点数据;

S12、根据标准化散点数据三维坐标压缩生成平面的灰度图像;

S13、将所述灰度图像转化成以数据点作为前景的二值图像;

S14、去除二值图像中小面积的前景以消除连接区域的稀疏像素;

S15、以二值膨胀操作外扩前景区域边界;

S16、在二值图像的前景目标内做孔洞填充处理。

2.根据权利要求1所述的流式细胞仪数据的设门方法,其特征在于,步骤S2包括以下子步骤:

S21、根据二值图像的中心坐标和面积大小排除杂质区域,确定聚类中心的数目;

S22、将前景目标二值图像转化为标记图像,逐个获取前景目标区域的中心坐标,标记确定聚类中心的位置。

3.根据权利要求1所述的流式细胞仪数据的设门方法,其特征在于,步骤S3包括以下子步骤:

S31、基于步骤S2从二值图像中获取的聚类中心位置,计算获取对应聚类中心所在区域的轮廓边界;

S32、将该轮廓边界向外偏置10%-30%;

S33、将偏置后的轮廓边界映射至原始数据中,形成初始设门曲线。

4.根据权利要求1所述的流式细胞仪数据的设门方法,其特征在于,步骤S4包括以下子步骤:

S41、计算原始数据中的所有数据点的局部密度,将数据点按照局部密度由大到小进行排序编号;

S42、计算每个数据点与所有在前编号的数据点之间的距离,记录该数据点与之距离最小的在前编号数据点的编号及距离;

S43、以聚类中心的数量和位置为基准进行聚类簇标记分区,聚类中心对应为该聚类簇的标记中心;

S44、按照编号顺序将所有数据点进行聚类簇归属分配,其依据为每个数据点归属于与之距离最小的数据点的同一聚类簇。

5.根据权利要求1所述的流式细胞仪数据的设门方法,其特征在于,步骤S5包括以下子步骤:

S51、基于每个聚类簇内数据点的分配情况,分别计算并生成完全包围各个聚类簇内所有数据点的最小凸多边形;

S52、判断所有最小凸多边形两两之间是否存在交集,若有则执行步骤S53,若无则执行步骤S54;

S53、以交集部分的交点连接直线分割交集归属构成新的最小凸多边形,然后执行步骤S54;

S54、将各个聚类簇的最小多边形作为凸包轮廓输出至原始数据中。

6.根据权利要求1所述的流式细胞仪数据的设门方法,其特征在于,步骤S6包括以下子步骤:

S61、判断各聚类簇的原始设门曲线是否超出与之对应的凸包轮廓,若是则执行步骤S62,若否则执行步骤S63;

S62、取原始设门曲线与对应凸包轮廓之间的交集替换为新的原始设门曲线;

S63、将原始设门曲线输出为最终设门曲线。

7.根据权利要求1所述的流式细胞仪数据的设门方法,其特征在于,步骤S4中,数据点之间的距离为笛卡尔欧氏距离,数据点的局部密度按照高斯核的方式进行计算。

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