[发明专利]一种真姬菇HM13菌种的SSR标记指纹图谱及其构建方法与应用有效
| 申请号： | 202110171379.2 | 申请日： | 2021-02-04 |
| 公开（公告）号： | CN112795688B | 公开（公告）日： | 2023-02-28 |
| 发明（设计）人： | 李燕;鲍大鹏;王莹;吴莹莹;万佳宁;尚俊军 | 申请（专利权）人： | 上海市农业科学院 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12Q1/04;C12N15/11 |
| 代理公司： | 南京灿烂知识产权代理有限公司 32356 | 代理人： | 王江南 |
| 地址： | 201106 *** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 真姬菇 hm13 菌种 ssr 标记 指纹 图谱 及其 构建 方法 应用 | ||
1.一种真姬菇HM13菌种的SSR标记的指纹图谱鉴定方法，其特征在于：所述指纹图谱由6个SSR标记位点组成，其对应的6对引物的具体序列如下：
HMSSR11正向引物：GGAGTTTGAGTTGAGGCAGC；
反向引物：ATGAACCAGACCAAAGACCG；
HMSSR18正向引物：GAGGATTGAAGGGACTGTCG；
反向引物：CCTCATCCTCCGACTCTACG；
HMSSR26正向引物：GTGATTGGGTTCGTGTCGTC；
反向引物：ACCTCGAGCTCAACTTCTGC；
HMSSR32正向引物：AACCTCCAGTCACAACCTGC；
反向引物：CCTTGCTTCTTGTCGGATGT；
HMSSR36正向引物：TCTTCTTGTAGAGCGCCTCG；
反向引物：CTCTCGACGCGTGTTCCT；
HMSSR38正向引物：TCTTCTTGTTCGGCGGTATC；
反向引物：ATCCGGCACAGGTAAAGATG；
相应带型编号组合为：6/(3+4)/(5+6)/6/(5+7)/4；
其中，引物HMSSR11对应的带型编号为6，其对应的等位基因片段的条带大小为286~286.99bp；
引物HMSSR18对应的带型编号为3+4，其中编号3对应的等位基因片段的条带大小为257~257.99bp，编号4对应的等位基因片段的条带大小为262~262.99bp；
引物HMSSR26对应的带型编号为5+6，其中编号5对应的等位基因片段的条带大小为132~132.99bp，编号6对应的等位基因片段的条带大小为135~135.99bp；
引物HMSSR32对应的带型编号为6，其对应的等位基因片段的条带大小为235~235.99bp；
引物HMSSR36对应的带型编号为5+7，其中编号5对应的等位基因片段的条带大小为162~162.99bp，编号7对应的等位基因片段的条带大小为170~170.99bp；
引物HMSSR38对应的带型编号为4，其对应的等位基因片段的条带大小为177~177.99bp；
所述真姬菇HM13菌种的保藏编号为GDMCCNo:61412。
2.权利要求1所述的真姬菇HM13菌种的SSR标记的指纹图谱的应用，其特征在于：所述真姬菇HM13菌种的SSR标记的指纹图谱用于鉴定真姬菇HM13菌种的特异等位变异，和/或鉴定真姬菇HM13菌种的特异性。
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