[发明专利]一种细胞膜识别及分割方法在审

专利信息
申请号: 202110172125.2 申请日: 2021-02-08
公开(公告)号: CN113284085A 公开(公告)日: 2021-08-20
发明(设计)人: 刘净心;慕潇;左彦飞 申请(专利权)人: 上海衡道医学病理诊断中心有限公司
主分类号: G06T7/00 分类号: G06T7/00;G06T7/11;G06T3/40;G06T5/30
代理公司: 上海申新律师事务所 31272 代理人: 吴轶淳
地址: 201900 上海*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 细胞膜 识别 分割 方法
【权利要求书】:

1.一种细胞膜识别及分割方法,其特征在于,包括以下步骤:

步骤S1,提供一细胞膜阳的免疫组织化学切片图像;

步骤S2,根据所述免疫组织化学切片图像获取一阳性染色图像;

步骤S3,根据所述染色图像获取一阳性细胞膜分割图像蒙版。

2.根据权利要求1所述的细胞膜识别及分割方法,其特征在于,所述步骤S2包括:

步骤S21,对所述免疫组织化学切片图像做染色分离处理得到对应多个通道的图像;

步骤S22,选取对应阳性染色通道的图像作为所述阳性染色图像;

步骤S23,对所述染色图像进行二值化处理,得到一阳性染色图像蒙版。

3.根据权利要求2所述的细胞膜识别及分割方法,其特征在于,所述步骤S3包括:

步骤S31,以至少两个不同的标准差对所述阳性染色图像做至少两次高斯模糊;

步骤S32,通过至少两次所述高斯模糊的结果计算获得差值;

步骤S33,根据所述差值计算获得所述权重矩阵;

步骤S34,将所述权重矩阵的元素缩放至一预设范围;

步骤S35,将缩放后的所述权重矩阵进行二值化,得到一阳性细胞膜图像蒙版;

步骤S36,对所述阳性细胞膜图像蒙版进行开操作,并对所述开操作结果进行膨胀,得到所述阳性细胞膜分割图像蒙版。

4.根据权利要求2所述的细胞膜识别及分割方法,其特征在于,所述步骤S21包括:

步骤S211,根据所述切片图像计算获得一光密度图;

步骤S212,根据所述光密度图计算获得一染色密度图;

步骤S213,对所述染色密度图进行转换得到所述多个通道的图像。

5.根据权利要求4所述的细胞膜识别及分割方法,其特征在于,

所述步骤S211中,所述光密度图的计算公式为其中I0=[255,255,255];

所述步骤S212中,所述染色密度图的计算公式为S=M-1OD,其中M为免疫组织化学染色矩阵;

所述步骤S213,所述染色密度图的转换公式为SRGB=e-S

6.根据权利要求3所述的细胞膜识别及分割方法,其特征在于,所述步骤S31中,所述高斯模糊通过以下公式进行:

其中,r为模糊半径,σ为正态分布的标准偏差,N为需要进行滤波的图像的维数。

7.根据权利要求6所述的细胞膜识别及分割方法,其特征在于,所述模糊半径的取值范围为0-10。

8.根据权利要求3所述的细胞膜识别及分割方法,其特征在于,所述步骤S31中,所述高斯模糊进行两次,两次高斯模糊的标准差分别为g1,g2,且g1及g2的取值范围均为1-30,其中g1g2;

所述步骤S32中,获得所述差值DoG的方法为,

DoGtmp=G1-G2;

其中G1为标准差为g1的高斯模糊结果,G2为标准差为g2的高斯模糊结果;

将DoGtmp于0-1的范围内缩放得到所述差值DoG。

9.根据权利要求3所述的细胞膜识别及分割方法,其特征在于,权重矩阵的计算公式为:

weighted_memb_DoG=DoG*(1-dab_1/255.0);

其中,weighted_memb_DoG为所述权重矩阵,DoG为所述差值,dab_1为所述阳性染色图像。

10.根据权利要求3所述的细胞膜识别及分割方法,其特征在于,所述预设范围为0-255。

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