[发明专利]药物敏感预测方法、电子设备及计算机可读存储介质有效
申请号: | 202110175355.4 | 申请日: | 2021-02-09 |
公开(公告)号: | CN112951327B | 公开(公告)日: | 2023-10-27 |
发明(设计)人: | 马少华;方璐;范家旗;冯懿琳;王旭康;王子天;戴琼海 | 申请(专利权)人: | 清华大学深圳国际研究生院 |
主分类号: | G16B30/00 | 分类号: | G16B30/00;G16B20/20;G16B25/10;G16B20/50;G16B50/30;G16H10/20;G16H20/10;G16H70/40 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 刘方 |
地址: | 518055 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 药物 敏感 预测 方法 电子设备 计算机 可读 存储 介质 | ||
1.药物敏感预测方法,其特征在于,包括:
获取待训练癌细胞组织的基因测序数据和药物特征数据;
根据所述药物特征数据对所述基因测序数据进行预处理,得到基因样本数据;
根据所述基因样本数据和所述药物特征数据进行验证处理,得到预测模型和基因预测列表;
通过所述预测模型和所述基因预测列表对待测癌细胞组织进行药物敏感性预测。
2.根据权利要求1所述的药物敏感预测方法,其特征在于,所述基因测序数据包括第一测序数据,所述药物特征数据包括药物敏感性数据;
对应的,所述获取待训练癌细胞组织的基因测序数据和药物特征数据,包括:
基于基因组数据库获取待训练癌细胞组织的所述第一测序数据和对应的所述药物敏感性数据。
3.根据权利要求2所述的药物敏感预测方法,其特征在于,所述根据所述药物特征数据对所述基因测序数据进行预处理,得到基因样本数据,包括:
对所述第一测序数据进行标准化处理,得到第一样本数据;
根据所述第一样本数据和所述药物敏感性数据的药敏相关系数对所述第一样本数据进行筛选,得到第二样本数据;
根据所述药物敏感性数据对所述第二样本数据进行评分判定,得到所述第二样本数据的评分参数;
基于所述评分参数对所述第二样本数据进行筛选处理,得到所述基因样本数据。
4.根据权利要求3所述的药物敏感预测方法,其特征在于,所述根据所述基因样本数据和所述药物特征数据进行验证处理,得到预测模型和基因预测列表,包括:
获取所述基因样本数据与所述药物敏感性数据的药敏相关系数,获取所述基因样本数据的评分参数,所述基因样本数据包括多个基因片段;
根据所述药敏相关系数和所述评分参数对所述多个基因片段进行降序排列;
对降序排列后的所述多个基因片段进行验证处理,得到所述预测模型的模型参数和基因列表数目;
根据所述基因列表数目生成所述基因预测列表,根据所述模型参数确定所述预测模型。
5.根据权利要求1所述的药物敏感预测方法,其特征在于,所述基因测序数据包括第二测序数据,所述药物特征数据包括药物效果分级数据;
对应的,所述获取待训练癌细胞组织的基因测序数据和药物特征数据,包括:
基于基因组图谱数据库获取待训练癌细胞组织的第二测序数据和药物效果分级数据。
6.根据权利要求5所述的药物敏感预测方法,其特征在于,所述根据所述药物特征数据对所述基因测序数据进行预处理,得到基因样本数据,包括:
对所述第二测序数据进行标准化处理,得到第三样本数据;
根据所述药物效果分级数据对所述第三样本数据进行检验,得到所述基因样本数据。
7.根据权利要求6所述的药物敏感预测方法,其特征在于,所述根据所述基因样本数据和所述药物特征数据进行验证处理,得到预测模型和基因预测列表,包括:
获取所述基因样本数据的多个基因片段的基因评分;
根据所述基因评分对所述多个基因片段进行降序排列;
对降序排列后的所述多个基因片段进行交叉验证,得到所述预测模型的模型参数和基因列表数目;
根据所述基因列表数目和对应的所述多个基因片段生成所述基因预测列表,根据所述模型参数确定所述预测模型。
8.根据权利要求4或7所述的药物敏感预测方法,其特征在于,所述通过所述预测模型和所述基因预测列表对所述待测癌细胞组织进行药物敏感性预测,包括:
根据所述基因预测列表获取待测癌细胞组织对应的基因片段;
获取所述基因片段的基因表达量;
将所述基因表达量输入所述预测模型中,获取所述待测癌细胞组织的药物敏感性结果。
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