[发明专利]大蒜GMBFV,PVY,GCLV病毒RT-PCR检测试剂盒在审
申请号: | 202110180682.9 | 申请日: | 2021-02-09 |
公开(公告)号: | CN112779360A | 公开(公告)日: | 2021-05-11 |
发明(设计)人: | 阳文龙;李锡香;王海平;王洋;宋江萍;张晓辉 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院蔬菜花卉研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11;C12R1/94 |
代理公司: | 北京知本村知识产权代理事务所(普通合伙) 11039 | 代理人: | 刘江良 |
地址: | 100081 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 大蒜 gmbfv pvy gclv 病毒 rt pcr 检测 试剂盒 | ||
1.一种大蒜GMBFV,PVY,GCLV病毒RT-PCR检测试剂盒,其特征在于,包含以下引物对组合:大蒜螨传丝状病毒引物,其上游特异性PCR引物如SEQ ID NO.1所示、下游特异性PCR引物如SEQ ID NO.2所示;大蒜普通潜隐病毒引物,其上游特异性PCR引物如SEQ ID NO.3所示、下游特异性PCR引物如SEQ ID NO.4所示,马铃薯Y病毒的上游特异性PCR引物如SEQ IDNO.5所示、下游特异性PCR引物如SEQ ID NO.6所示。
2.一种利用权利要求1所述的试剂盒同时检测大蒜GMBFV,PVY,GCLV病毒的方法,其特征在于,具体按照以下步骤进行:
1) 取大蒜组织,提取大蒜组织的总RNA;
2) 以提取的RNA为模板,用6碱基随机引物反转录得到cDNA;
3) 以cDNA为模板,采用权利要求1所述试剂盒中的引物对组合对其进行PCR扩增;
4) 对PCR产物凝胶电泳,根据目的片段大小,检测大蒜组织中的病毒种类,其中,大蒜螨传丝状病毒GMBFV的特异扩增产物为625bp,大蒜普通潜隐病毒GCLV的特异扩增产物为450bp,马铃薯Y病毒PVY的特异扩增产物为272bp。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤1)中,RNA的提取方法为:每50-100 mg大蒜组织加入1mL TRIzol® RNA分离试剂,剧烈震荡30 s,室温放置5 min,加入0.2倍体积的氯仿剧烈震荡30 s,室温放置5 min,12000rpm、4℃离心10 min;取上清加入新离心管中,加入等体积氯仿剧烈震荡30 s,室温放置5 min,12000rpm、4℃离心10 min;取上层水相于一新的离心管,加入0.6倍体积的预冷异丙醇,上下颠倒混匀,12000rpm、4℃离心15min;保留离心管底的RNA沉淀,加入1mL 75%的乙醇(DEPC水配制)洗沉淀,涡旋混匀,4℃下8000rpm离心弃去上清液,然后室温或真空干燥5-10分钟;将RNA溶于25-40μL双蒸水(DEPC水)中,55℃-60℃水溶10分钟,即得。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述步骤1)还包括RNA检测方法,具体为:用琼脂糖凝胶电泳检测是否提出了RNA以及RNA是否降解,操作如下:用天平称取1g琼脂糖倒入三角瓶中,加入100mL 1×TAE,微波炉加热溶解琼脂糖;待凉至55℃-60℃时,加入5μL核酸染色剂GeneGreen并摇匀;然后倒入制胶模中,插入试样格;在冰板上加入1μL RNA上样缓冲液、4μL dd H2O和2μL RNA 之后混匀;点样, 150V电泳20min;电泳结束后将胶置于凝胶成像仪中进行观察,依据条带分析提取的RNA质量。
5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤2)中,反转录反应液:50μM 的Random6 mers lμL,10 mM dNTP 1μL,总RNA 4μL,不含RNA酶的双蒸水4μL;在PCR仪上65℃、5 min后冰上急冷进行变性;在上述反应液中加入5×PrimeScript® Buffer 4μL,40 U/μL 的RNA酶抑制剂0.5μL,200 U/μL的逆转录酶1μL,不含RNA酶的双蒸水4.5μL;反转录程序:30℃10 min,42℃ 50 min,95℃ 5 min,一次循环后冰上急冷,得到cDNA。
6.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤3)中,配制PCR反应液为:10×PCR缓冲液2.5μL,双蒸水13μL,MgCl2 2.5μL,dNTP(2mM/mL) 2μL,cDNA 2.5μL,Taq酶0.5μL,上游特异性PCR引物 1μL,下游特异性PCR引物 1μL;PCR程序:94℃变性5 min,然后94℃ 30s,55℃30s,72℃ 1 min共35个循环;最后72℃延伸10 min。
7.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤1)中,大蒜组织为大蒜嫩叶或愈伤组织。
8.一种用于多重PCR同时检测三种大蒜病毒的引物对组合,其特征在于:其由三对引物组合而成,所述引物分别如下:
大蒜螨传丝状病毒的上游特异性PCR引物如SEQ ID NO.1所示、下游特异性PCR引物如SEQ ID NO.2所示,大蒜普通潜隐病毒的上游特异性PCR引物如SEQ ID NO.3所示、下游特异性PCR引物如SEQ ID NO.4所示,马铃薯Y病毒的上游特异性PCR引物如SEQ ID NO.5所示、下游特异性PCR引物如SEQ ID NO.6所示。
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