[发明专利]一种检测慢病毒介导的基因修饰细胞中复制型病毒的引物组、试剂盒及方法在审
申请号: | 202110191399.6 | 申请日: | 2021-02-19 |
公开(公告)号: | CN112877474A | 公开(公告)日: | 2021-06-01 |
发明(设计)人: | 焦顺昌;张嵘;汪坤福;焦慧 | 申请(专利权)人: | 北京鼎成肽源生物技术有限公司;焦顺昌 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 董大媛 |
地址: | 102200 北京市昌平区双*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 病毒 基因 修饰 细胞 复制 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一种检测慢病毒介导的基因修饰细胞中复制型病毒的引物组,其特征在于,包括RCL-1引物组或RCL-2引物组;所述RCL-1引物组包括引物FP-1、引物RP-1和荧光探针P1;所述RCL-2引物组包括引物FP-2、引物RP-2和荧光探针P2;所述引物FP-1、引物RP-1和荧光探针P1的核苷酸序列分别如SEQ ID No.1~SEQ ID No.3所示,所述引物FP-2、引物RP-2和荧光探针P2的核苷酸序列分别如SEQ ID No.4~SEQ ID No.6所示。
2.一种检测慢病毒介导的基因修饰细胞中复制型病毒的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的引物组和检测试剂。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述引物FP-1、引物RP-1和荧光探针P1的使用浓度独立为8~12μmol/L;所述引物FP-2、引物RP-2和荧光探针P2的使用浓度独立为8~12μmol/L。
4.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述检测试剂包括qPCR扩增MIX、阳性标准品和阴性质控品。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述阳性标准品为复制型vsvg质粒。
6.一种检测慢病毒介导基因修饰的细胞中复制型病毒的方法,包括以下步骤:
1)提取待检测细胞的总RNA后,反转录获得反转录产物;
2)以步骤1)中获得的反转录产物为模板,以权利要求1中所述的RCL-1引物组或RCL-2引物组为引物进行qPCR扩增获得待检测细胞qPCR扩增的Ct值;
3)当Ct值≥33.92时,所述待检测细胞中不存在复制型病毒,当Ct值<33.92时,所述待检测细胞中存在复制型病毒。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤2)中所述qPCR扩增的扩增体系,以20μL计,包括RNA模板4μL、引物FP-1 0.4μL、引物RP-1 0.4μL、荧光探针P1 0.4μL、qPCR扩增MIX10μL和ddH2O 4.8μL;
或者包括RNA模板4μL、引物FP-2 0.4μL、引物RP-2 0.4μL、荧光探针P2 0.4μL、qPCR扩增MIX 10μL和ddH2O 4.8μL。
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤2)中所述qPCR扩增的扩增程序包括以下步骤:95℃10min;95℃15s,60℃1min,40个循环。
9.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤1)中所述待检测细胞设置2~4个重复。
10.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,当采用RCL-2引物组为引物进行qPCR扩增时,将所述反转录产物线性化后作为模板。
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