[发明专利]一种苹果砧木矮化性辅助筛选分子标记及其应用

权利要求书

1.一种苹果砧木矮化性辅助筛选分子标记，其特征在于，所述苹果砧木矮化性辅助筛选分子标记为a1、a2或a3；

a1苹果砧木基因组中“侧向生长组织发育基因MdLBD3”转录起始位点上游存在的11bp的Deletion多态，所述Deletion多态与砧木矮化性紧密连锁；所述a1的特征DNA分子序列为5′-TCAACAACATA-3′；

a2根据所述11bp的Deletion多态，设计一对引物：

MdLBD3-d-F：5′-GTCGTTGGCCTCTATTCTTCTGCAG-3′；

MdLBD3-d-R：5′-TCAAACAGACACCAAGTAGTTCCGT-3′；

所述a2是苹果基因组中“侧向生长组织发育基因MdLBD3”自起始密码子向前5’端开始计的第326-349位核苷酸；

以苹果砧木实生苗或种质资源的DNA为模板，20μLPCR扩增的反应体系，PCR扩增的反应程序为：94℃5min；94℃30s、59℃30s、72℃50s，36个循环；72℃7min，4℃保存；等反应程序下PCR产生经1.5％琼脂糖电泳检测后，如在550bp处存在条带，则表明该材料为矮化型砧木；如果不存在PCR产物，或在550bp处无条带，则表明该材料为乔化型砧木；

a311bp的插入多态及开发设计的引物序列的同源性大于95％、98％或99％的DNA分子。

2.如权利要求1所述的苹果砧木矮化性辅助筛选分子标记，其特征在于，所述PCR扩增的反应体系组成如下：2×PCR Mix 10μL，MdLBD3-d-F溶液1.0μL，MdLBD3-d-R溶液1.0μL，模板溶液2.0μL，ddH₂O 6.0μL；MdLBD3-d-F溶液中，MdLBD3-d-F的浓度为10μM；MdLBD3-d-R溶液中，MdLBD3-d-R的浓度为10μM；模板溶液中，DNA浓度为500ng/μL。

3.一种如权利要求1～2任意一项所述的苹果砧木矮化性辅助筛选分子标记的苹果砧木矮化性辅助筛选分子标记的应用，其特征在于，所述苹果砧木矮化性辅助筛选分子标记的应用包括：鉴定苹果砧木的矮化性状；预测苹果砧木的矮化性状；以及选育具有不同矮化性状的苹果砧木。

4.如权利要求3所述的苹果砧木矮化性辅助筛选分子标记的应用，其特征在于，所述预测苹果砧木的矮化性状的方法，包括：检测待测苹果砧木基于所述分子标记的基因型，LdLi基因型苹果砧木的矮化性LiLi基因型苹果砧木的矮化性；

如果待测苹果砧木的两条染色体中有两条存在所述Deletion分子标记，则待测苹果砧木的基因型为LdLd基因型；如果待测苹果的一条染色体存在所述Deletion分子标记，则待测苹果的基因型为LdLi基因型；如果待测苹果的两条染色体均不存在所述Deletion分子标记，则待测苹果的基因型为LiLi基因型。

5.如权利要求3所述的苹果砧木矮化性辅助筛选分子标记的应用，其特征在于，所述选育具有不同矮化性状的苹果砧木的方法，包括：检测待测苹果砧木基于所述分子标记的基因型，LdLi基因型苹果砧木的矮化性LiLi基因型苹果砧木的矮化性；

如果待测苹果的两条染色体均缺失所述分子标记，待测苹果的基因型为LdLd基因型；如果待测苹果的一条染色体均具有所述分子标记，待测苹果的基因型为LdLi基因型；

所述矮化性为苹果砧木的矮化性，即对嫁接于砧木上的接穗的生长势具有致其矮化的能力，表现为植株的矮化、主干直径较细、植株冠较小特征。