[发明专利]一种基于aGVHD biomarker的重度肠道aGVHD模型的方法在审

专利信息
申请号: 202110211665.7 申请日: 2021-02-25
公开(公告)号: CN112951332A 公开(公告)日: 2021-06-11
发明(设计)人: 管迪;李晓博 申请(专利权)人: 北京博富瑞基因诊断技术有限公司
主分类号: G16B40/00 分类号: G16B40/00;G16B20/00
代理公司: 北京科家知识产权代理事务所(普通合伙) 11427 代理人: 钟斌
地址: 100176 北京市大兴区北京*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 agvhd biomarker 重度 肠道 模型 方法
【权利要求书】:

1.一种基于aGVHD biomarker的重度肠道aGVHD模型的方法,其特征在于,包括aGVHDbiomarker指标监测及数据筛选与分组、单个重度肠道aGVHD模型训练、多模型融合、重度肠道aGVHD模型性能前瞻性验证的四个步骤:

S1、aGVHD biomarker指标监测及数据筛选与分组,动态监测多中心病人群体重要时间点的aGVHD biomarker指标,并根据随访至HSCT后100天内病人是否发生肠道aGVHD进行分组,其中,发生肠道aGVHD组筛选事件发生时间点监测到的aGVHD biomarker指标,未发生肠道aGVHD组按与发生肠道aGVHD组biomarker测量时间分布相同原则筛选监测到的aGVHDbiomarker指标,形成模型数据集;

S2、单个重度肠道aGVHD模型训练,对S1中提及的模型数据集按比例随机分为训练和测试集,将病人aGVHD biomarker指标与临床重度肠道aGVHD进行关联,采用机器学习领域先进的堆叠技术、逻辑回归技术,建立精准划分重度肠道aGVHD严重程度的机器学习模型;

S3、多模型融合,采用多模型融合技术,筛选多个模型效果良好的肠道aGVHD模型,对病人发生肠道aGVHD的严重程度使用评分方法进行评分,评分结果在模型数据集上ROC-AUC达到0.90以上,灵敏度、特异性达到0.80以上;

S4、重度肠道aGVHD模型性能前瞻性验证,监测参与模型训练之外的多中心病人群体的重要时间点的aGVHD biomarker指标,采用S1中提及的数据筛选及分组原则,形成模型验证集,多模型融合后的重度肠道aGVHD模型在验证集上ROC-AUC达到0.84左右,灵敏度、特异性达0.80以上,模型能够对肠道aGVHD严重程度进行更加精准划分,且稳定可靠。

2.根据权利要求1所述的一种基于aGVHD biomarker的重度肠道aGVHD模型的方法,其特征在于,所述aGVHD biomarker的指标包括sST2、REG3α、IL-6、IL-8以及TNFR1。

3.根据权利要求1所述的一种基于aGVHD biomarker的重度肠道aGVHD模型的方法,其特征在于,所述S1中,筛选过程中必须保证一个病人一条数据。

4.根据权利要求1所述的一种基于aGVHD biomarker的重度肠道aGVHD模型的方法,其特征在于,所述S2中,单个重度肠道aGVHD模型在模型训练集和模型测试集上ROC-AUC位于0.85±0.1,灵敏度和特异性的数值达0.75以上。

5.根据权利要求1所述的一种基于aGVHD biomarker的重度肠道aGVHD模型的方法,其特征在于,所述多中心病人群体的标准为重度肠道aGVHD占13%的病人群体。

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