[发明专利]一种与黄鳍棘鲷快速生长相关的SNP位点、其筛选方法及应用

权利要求书

1.一种黃鳍棘鲷MSTN2b基因，其特征在于，所述MSTN2b基因的序列为SEQ ID NO:1。

2.一种与黃鳍棘鲷快速生长相关的SNP位点，其特征在于，包括三个SNP位点，分别命名为SNP1885、SNP1888、SNP1915，其中所述SNP1885位点位于MSTN2b基因自5’端起的第1885个碱基，其碱基为A或G，所述SNP1888位点位于MSTN2b基因自5’端起的1888个碱基，其碱基为A或G，所述SNP1915位点位于MSTN2b基因自5’端起的第1915个碱基，其碱基为T或C，所述MSTN2b基因的序列为SEQ ID NO:1。

3.一种用于检测权利要求2所述的SNP位点的引物，其特征在于，引物包括：SNP-R：5’-TTCTTCTTCCAGACAATCC-3’，SNP-L：5’-AAAAAGTGCCACATCCC-3’。

4.一种与黃鳍棘鲷快速生长相关的SNP位点筛选方法，其特征在于，包括以下步骤：

S 1随机选取10个黃鳍棘鲷个体的基因组DNA，以权利要求3所述的引物对为上下游引物，PCR扩增151bp；

S2扩增后使用1％琼脂糖凝胶电泳检测，凝胶图中有均一条带的样品进行测序；

S3随机选取黃鳍棘鲷个体171尾，并进行基因分型，获得SNP位点。

5.根据权利要求4所述的筛选方法，其特征在于，步骤S3中包括：利用R语言aov和lm函数构建线性分析模型进行基因多态性与性状间关联分析，所述线性分析模型为yij＝u+Gi+eij，

其中，yij为性状表型值，u为群体均值，Gi为标记基因型效应值，eij为随机残差效应，统计数据用平均值±标准差表示；

若某一性状在标记不同基因型间呈现显著或极显著差异，利用LSD.test、TukeyHSD和snk.test函数进行多重比较。

6.根据权利要求2所述的SNP位点在黃鳍棘鲷选育中的应用。

7.根据权利要求6所述的应用，其特征在于，所述SNP1885位点的AA基因型个体的体重大于AG或GG基因型个体；所述SNP位点的AA基因型个体的眼间距大于AG或GG基因型个体；所述SNP位点的AA基因型个体的躯干长大于AG基因型个体；所述SNP位点的AA基因型个体的尾长大于AG或GG基因型个体；所述SNP位点的AA基因型个体的尾柄长大于AG或GG基因型个体；所述SNP位点的AA基因型个体的尾柄高大于AG基因型个体；SNP位点的AA基因型个体的全长大于AG或GG基因型个体。

8.根据权利要求6所述的应用，其特征在于，所述SNP1888位点的GG基因型个体的体重大于AG或AA基因型个体；所述SNP位点的GG基因型个体的眼间距大于AG或AA基因型个体；所述SNP位点的GG基因型个体的眼后头长大于AG或AA基因型个体；所述SNP位点的GG基因型个体的体高大于AG基因型个体；所述SNP位点的GG基因型个体的尾长大于AG或AA基因型个体；所述SNP位点的GG基因型个体的尾柄长大于AG或AA基因型个体；所述SNP位点的GG基因型个体的体长大于AG或AA基因型个体。

9.根据权利要求6所述的应用，其特征在于，所述SNP1915位点的TT基因型个体的体重大于CT或CC基因型个体；所述SNP位点的TT基因型个体的眼后头长大于CT或CC基因型个体。

10.一种黃鳍棘鲷亲本选育的方法，其特征在于，所述方法是筛选具有权利要求2所述的SNP位点来实现的。