[发明专利]一种用于筛查疑难性遗传性骨病的基因组合物、芯片和试剂盒

说明书

本发明提供了一种用于筛查疑难性遗传性骨病的基因组合物、芯片和试剂盒，该基因组合物包括322个遗传性骨病相关致病基因。本发明提供的一组与遗传性骨病相关的基因组合物及其相关产品(基因芯片和试剂盒)，针对我国疑难性骨病诊疗困难这一需求，在现有对遗传性骨病的了解基础上，结合基因组测序及大数据分析，开发可用于诊断各种遗传性骨病的靶向捕获测序试剂盒，该试剂盒的优点在于：可以灵活的自定义探针，特异性的捕获目标的基因和区域，尤其是在WES里面没有包含的致病区域也可以进行捕获测序；可以针对WES捕获不到的区域进行补充和优化，达到更好的捕获效果，覆盖率高、变异检测精度高；性价比会更高，针对临床检测会更快，费用更低。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，尤其涉及一种用于筛查疑难性遗传性骨病的基因组合物、芯片和试剂盒。

背景技术

遗传性骨病是指由于遗传因素改变导致骨骼发育异常的遗传性疾病，临床表型包括生长迟缓、身材矮小、长骨畸形、关节活动受限等，临床和遗传异质性大。虽然它们发病率低，但其致畸、致残率较高，大多幼年发病，且会逐代或隔代遗传，给患者及其家属带来巨大的精神负担和经济负担。因此明确诊断对于患者的后续治疗、优生优育均有重大意义。

目前临床医生对于遗传性骨病的诊断一般基于患者的临床病史资料、实验室检查指标、影像学检查以及基因检测，但是大多数遗传性骨病的患者并未得到明确的诊断及充分的治疗，具体存在以下几个原因：1、直到2019年，共发现了461种遗传性骨病，骨病种类繁多且较为少见，大部分骨病往往仅表现为骨骼的畸形，没有血尿生化的异常，医师未进行过系统的培训，对该类疾病的认识不足导致无法明确诊断；2、遗传性骨病之间有部分骨病表型重叠，大部分遗传骨病会表现为身材矮小，但导致身材矮小的原因各异，软骨发育不全、脊柱骨骺发育不良、假性软骨发育不良均可有身材矮小的表现；3、遗传性骨病的遗传异质性较高，同种疾病可有多种致病基因，例如成骨不全症可由COL1A1、COL1A2、IFITM5、FKBP10等多个基因突变导致，临床上往往只能根据患者病史资料进行大体诊断，无法具体分型进行个体化治疗；同一种基因突变导致不同类型的疾病，例如COL2A1基因突变可以导致脊柱骨骺发育不良、多发性骨骺发育不良伴视力及听力障碍、Kniest骨发育不良等疾病，给诊断增加了巨大的难度。

遗传性骨病的致病基因较多，医生往往无法精确定位致病基因，需要逐一对候选基因测序来确定致病与否，无形中增加了测序的成本和时间。而且在测序过程中，测序数据会出现含N比例过大，测序质量较低的碱基数占比例较高，序列污染等均会导致reads质量降低，影响后续分析，GC含量较高致使覆盖率较差、捕获率较低。

因此，需要一种优化的检测遗传性骨病相关基因的产品和方法。

发明内容

本发明针对现有技术的不足，提供了一种用于筛查疑难性遗传性骨病的基因组合物、芯片和试剂盒，该试剂盒适用于筛查中国人遗传性骨病。

为实现上述目的，本发明采用以下技术方案：

第一方面，本发明提供了一种用于筛查疑难性遗传性骨病的基因组合物，该基因组合物包括如下322个基因：