[发明专利]一对用于黄瓜微型化性状鉴定的SNP标记的引物、试剂盒、应用和方法

说明书

本发明提供了一对用于黄瓜微型化性状鉴定的SNP标记的引物、试剂盒、应用和方法，属于分子生物学技术领域。本发明提供的用于黄瓜微型化性状鉴定的SNP标记的引物，包括正向引物F和反向引物R；所述正向引物F的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示；所述反向引物R的核苷酸序列如SEQIDNO.2所示。本发明提供的用于黄瓜微型化性状鉴定的SNP标记的引物可快速对黄瓜微型化性状进行鉴定，能够有效解决表型鉴定结果可靠性低、费时、成本高、难度大等问题。

技术领域

本发明属于分子生物学技术领域，具体涉及一对用于黄瓜微型化性状鉴定的SNP标记的引物、试剂盒、应用和方法。

背景技术

黄瓜属葫芦科甜瓜属一年生蔓生草本植物，是世界上十大蔬菜作物之一。尽管黄瓜的地理分布十分广泛，但其遗传基础狭窄，导致现有可用于各种表型基因研究的材料较为缺乏，阻碍了黄瓜功能基因组学和遗传研究工作的快速发展。株型是指植物体的形态特征及空间排列方式，决定着植株的受光姿态，直接影响作物的光合效率。株型也是决定作物栽培方式的主要因子。因此，理想株型的选育对作物高效生产具有重要的理论和实践意义。目前生产中栽培的黄瓜多为蔓生品种，主蔓长度在2～3米左右。但因其生长密集，叶片堆叠程度大，常常会影响光合作用，降低光合产量，而且也易造成病害的产生和传播，最终影响栽培黄瓜的经济效益。目前生产上常常投入较多的人力进行绑蔓、打枝、疏叶摘心等工作，增加了生产成本。因此，株高适宜，叶片分布合理，可满足不同栽培条件的黄瓜理想株型的选育是黄瓜高产育种的一个重要方向，对黄瓜高效生产具有重要的理论和实践意义。而利用常规育种方法的表型鉴定来选育具有微株型表型的黄瓜品种具有耗时长，成本高、难度大等缺点。因此，迫切需要一种简单有效的黄瓜微型化性状鉴定方法。

发明内容

为了解决上述问题，本发明提供了一对用于黄瓜微型化性状鉴定的SNP标记的引物、试剂盒、应用和方法。本发明提供的用于黄瓜微型化性状鉴定的SNP标记的引物可快速对黄瓜微型化性状进行鉴定。

为了实现上述目的，本发明提供如下技术方案：

本发明提供了一对用于黄瓜微型化性状鉴定的SNP标记的引物，包括正向引物F和反向引物R；

所述正向引物F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；

所述反向引物R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。

优选的，SNP位点的物理位置为黄瓜‘Chinese Long’基因组v2版本参考序列黄瓜7号染色体17507331核苷酸位点。

本发明提供了一种用于黄瓜微型化性状鉴定的试剂盒，所述试剂盒包括上述技术方案中所述的引物。

本发明提供了上述技术方案中所述的引物或上述技术方案中所述的试剂盒在筛选黄瓜微型化性状的辅助育种中的应用。

本发明提供了上述技术方案中所述的引物或上述技术方案中所述的试剂盒在黄瓜微型化性状鉴定中的应用。

本发明提供了一种基于上述技术方案中所述的引物或上述技术方案中所述试剂盒的鉴定黄瓜微型化性状的方法，包括如下步骤：以待检黄瓜基因组DNA为模板，利用上述技术方案中所述的引物或上述技术方案中所述试剂盒进行PCR扩增，得到扩增产物，对待测黄瓜进行基因分型；根据基因分型的结果进行黄瓜微型化性状的判定。

优选的，所述基因分型的方法包括：当SNP位点的基因型为TT时，鉴定为微型化黄瓜；当SNP位点的基因型为CC时，鉴定为正常株型黄瓜；当SNP位点的基因型为TC时，鉴定为中间株型黄瓜。

有益效果：