[发明专利]基于胸部CT图像的EGFR基因突变检测方法和系统有效

专利信息
申请号: 202110268251.8 申请日: 2021-03-11
公开(公告)号: CN113017674B 公开(公告)日: 2021-12-31
发明(设计)人: 杨晓燕;刘敏 申请(专利权)人: 中日友好医院(中日友好临床医学研究所)
主分类号: A61B6/03 分类号: A61B6/03;G06T7/00;G06T7/11
代理公司: 北京预立生科知识产权代理有限公司 11736 代理人: 李红伟;孟祥斌
地址: 100029*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 基于 胸部 ct 图像 egfr 基因突变 检测 方法 系统
【权利要求书】:

1.一种基于胸部CT图像的EGFR基因突变检测方法,其特征在于,包括:

接收待处理的胸部CT图像;

从所述胸部CT图像上提取多个目标影像组学特征的特征变量,其中,每个所述目标影像组学特征,在第一显著性水平上不具有胸部平扫CT和胸部增强CT的显著性差异,在第二显著性水平上具有EGFR突变阳性和EGFR突变阴性的显著性差异;

根据回归模型和所述特征变量,得到与所述待处理的胸部CT图像对应的评分值;和

根据所述评分值,确定所述待处理的胸部CT图像所属的肺癌患者EGFR基因突变检测结果,所述检测结果反映了所述EGFR基因突变的概率。

2.根据权利要求1所述的基于胸部CT图像的EGFR基因突变检测方法,其特征在于,所述从所述胸部CT图像上提取多个目标影像组学特征的特征变量,包括:对所述待处理的胸部CT图像进行肿瘤区域分割,得到待处理的胸部CT图像的肿瘤区域;和

从待处理的胸部CT图像的肿瘤区域内提取多个目标影像组学特征的特征变量。

3.根据权利要求1所述的基于胸部CT图像的EGFR基因突变检测方法,其特征在于,所述目标影像组学特征通过以下方法获得:

从目标样本胸部CT图像集合中的每个样本胸部CT图像上分别提取多个影像组学特征的特征变量,所述目标样本胸部CT图像集合中的部分样本胸部CT图像对应EGFR基因突变阳性,部分样本胸部CT图像样本对应EGFR基因突变阴性;所述目标样本胸部CT图像集合中的部分样本胸部CT图像为平扫CT图像,部分样本胸部CT图像为增强CT图像;

对所有影像组学特征,通过进行两次曼-惠特尼U检验筛选出候选影像组学特征,所述候选影像组学特征在第一显著性水平上不具有胸部平扫CT和胸部增强CT的显著性差异,在第二显著性水平上具有EGFR突变阳性和EGFR突变阴性的显著性差异;和

对所有候选影像组学特征进行特征降维,得到多个目标影像组学特征。

4.根据权利要求3所述的基于胸部CT图像的EGFR基因突变检测方法,其特征在于,所述从目标样本胸部CT图像集合中的每个样本胸部CT图像上分别提取多个影像组学特征的特征变量;包括:

对目标样本胸部CT图像集合中的每个样本胸部CT图像进行肿瘤分割,得到每个样本胸部CT图像的肿瘤区域;和

从每个样本胸部CT图像的肿瘤区域内分别提取多个影像组学特征的特征变量。

5.根据权利要求3所述的基于胸部CT图像的EGFR基因突变检测方法,其特征在于,所述对所有候选影像组学特征进行特征降维,得到多个目标影像组学特征,包括:

针对所有候选影像组学特征,计算其中的每一对影像组学特征的皮尔森相关系数r;

对于|r|大于预设值的每一对影像组学特征,保留其中在EGFR突变阳性和EGFR突变阴性上差异显著性较大的影像组学特征,保留的影像组学特征和|r|小于等于预设值的每一对影像组学特征组成低相关性影像组学特征集合;和

在所述低相关性影像组学特征集合中,采用Boruta算法进行筛选,得到多个目标影像组学特征。

6.根据权利要求1所述的基于胸部CT图像的EGFR基因突变检测方法,其特征在于,所述根据所述评分值,确定所述待处理的胸部CT图像所属的肺癌患者EGFR基因突变检测结果,所述检测结果反映了所述EGFR基因突变的概率,包括:

将所述评分值与预设的评分截断值进行比较,根据比较结果确定所述待处理的胸部CT图像所属的肺癌患者EGFR基因突变概率高或EGFR基因突变概率低。

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