[发明专利]一种地方土鸡线粒体COI基因的扩增引物

说明书

本发明公开了一种地方土鸡线粒体COI基因的扩增引物，属于COI基因扩增引物领域领域，该引物序列为：COI‑F：5’‑CTTTAGCCGGCAACCTAGCC‑3’，COI‑R：5’‑GACGTGCCTCCTTGTTAATT‑3’。本发明筛选出一对用于扩增地方土鸡线粒体部分COI序列的引物COI‑F和COI‑R，并确定了其反应体系和PCR扩增条件，经实验证明该引物具特异性好的特点，能够满足地方土鸡遗传多样性研究的需要,也能为种质资源保护、开发和利用提供可靠的分子技术指导。

技术领域

本发明涉及扩增引物领域，具体涉及一种地方土鸡线粒体COI基因的扩增引物。

背景技术

鸡是最受欢迎和传播最广泛的家禽品种之一，它为世界各地的人类提供了大量的动物蛋白(肉和蛋)。此外，鸡在社会文化和生物医学研究中也发挥着重要作用。地方土鸡是一种宝贵的遗传资源，它们对当地环境的高度适应性使它们能够很好地生存。

由于世界范围内的选择和驯化，地方土鸡具有很大的遗传多样性。物种内部的遗传多样性可以提高对恶劣环境的适应能力和对疾病的抵抗力。毫无疑问，减少地方土鸡的遗传多样性是一种宝贵的遗传资源的损失。地方土鸡种群也可以增加其他土鸡以及纯种商业鸡品种的现有遗传多样性。由于使用了高产的商业鸡品种，一些地方土鸡品种的遗传多样性已经减少，因此，需要加强对地方土鸡遗传多样性的保护。

线粒体脱氧核糖核酸(Mitochondrial DNA，即mtDNA)由染色体外小DNA组成，具有母体遗传、结构简单、组织保守、基因组体积小、突变率高的特点。由于这些特点，线粒体基因可作为重要的分子标记用于生物分子种群遗传学和分子系统学的研究。其中，COI基因被广泛的应用于遗传多样性，系统发育，分类鉴别和母系起源等研究。但是到目前为止，地方土鸡的COI基因还没有广泛使用且特异性较好的通用引物。因此，筛选特异性较好的COI基因引物能够对地方土鸡的遗传多样性评估和种质资源的保护与利用提供技术条件。

发明内容

本发明的目的在于提供一种地方土鸡线粒体COI基因的扩增引物，其可以解决上述背景技术中提出的技术问题。

为实现上述目的，本发明提供如下技术方案：

一种地方土鸡线粒体COI基因的扩增引物，该引物序列为：

COI-F：5’-CTTTAGCCGGCAACCTAGCC-3’，

COI-R：5’-GACGTGCCTCCTTGTTAATT-3’。

优选地，一种所述的地方土鸡线粒体COI基因的扩增引物的筛选方法，包括以下步骤：

(1)登陆NCBI，下载已有的地方土鸡线粒体COI序列；

(2)将下载的序列比对分析，确定序列两端保守区域；

(3)在确定的保守区域用引物设计软件设计多对引物，并进行合成；

(4)将地方土鸡血液提取DNA，然后分别和合成的多对引物在反应体系下进行PCR反应，检测引物的扩增情况；

(5)进行琼脂糖凝胶电泳检测，筛选出条带明亮且单一的一对引物COI-F和COI-R:

COI-F：5’-CTTTAGCCGGCAACCTAGCC-3’，

COI-R：5’-GACGTGCCTCCTTGTTAATT-3’。

优选地，所述步骤(1)中，登陆NCBI下载已有的地方土鸡线粒体COI序列。

优选地，所述步骤(2)中，将下载的序列用DNAMAN 8.0软件比对分析。

优选地，所述步骤(3)中，引物设计软件为Primer Premier 5。