[发明专利]一种基于Y-STR基因座和Y-Indel的荧光检测试剂盒及其使用方法和应用在审
申请号: | 202110282149.3 | 申请日: | 2021-03-16 |
公开(公告)号: | CN113025725A | 公开(公告)日: | 2021-06-25 |
发明(设计)人: | 文少卿;徐旭鼎;林大钧;郑诚浩;李元元;雷波 | 申请(专利权)人: | 广州深晓基因科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858 |
代理公司: | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人: | 巩克栋 |
地址: | 510663 广东省广州市黄*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 str 基因 indel 荧光 检测 试剂盒 及其 使用方法 应用 | ||
1.一种基于Y-STR基因座和Y-Indel的荧光检测试剂盒,其特征在于,所述荧光检测试剂盒中包含用于同时扩增38个STR基因座和3个Y-Indel的41个引物对;
所述3个Y-Indel为rs199815934,rs771783753和rs759551978;
所述38个Y-STR基因座为:DYS533、DYS19、DYS635、DYS456、DYS447、DYS444、DYS645、DYS643、DYS460、DYS437、DYS439、DYS557、DYS385a、DYS385b、DYF387S1a、DYF387S1b、DYS522、DYS549、DYS389I、DYS448、DYS389II、DYS596、GATA H4、DYS518、DYS393、DYS391、DYS390、DYS392、DYS449、DYS527a、DYS527b、DYS593、DYS438、DYS576、DYS570、DYS481、DYS627和DYS458。
2.根据权利要求1所述的荧光检测试剂盒,其特征在于,所述引物对中至少一条序列的5′端携带荧光染料标记物,所述荧光染料标记物包括FAM、JOE、TAM、ROX、AF594或AF633中的任意一种;
优选地,所述41个引物对按携带荧光染料标记物的种类分为5组,所述荧光染料标记物包括FAM、JOE、TAM、ROX和AF594。
3.根据权利要求1或2所述的荧光检测试剂盒,其特征在于,所述41个引物对按携带荧光染料标记物的种类分为5组:
第一组包括扩增rs199815934,rs771783753、rs759551978、DYS533、DYS19、DYS635、DYS456、DYS447、DYS444和DYS645的引物对,荧光标记颜色为蓝色;
第二组包括扩增DYS643、DYS460、DYS437、DYS439、DYS557、DYS385a、DYS385b、DYF387S1a、DYF387S1b和DYS522的引物对,荧光标记颜色为绿色;
第三组包括扩增DYS549、DYS389I、DYS448、DYS389II、DYS596、GATA H4和DYS518的引物对,荧光标记颜色为黄色;
第四组包括扩增DYS393、DYS391、DYS390、DYS392、DYS449、DYS527a、DYS527b和DYS593的引物对,荧光标记颜色为红色;
第五组包括扩增DYS438、DYS576、DYS570、DYS481、DYS627和DYS458的引物对,荧光标记颜色为紫色。
4.根据权利要求1~3任一项所述的荧光检测试剂盒,其特征在于,所述荧光检测试剂盒中各引物对的浓度相同或不同;
优选地,所述引物对中上引物和下引物的浓度相同,所述上引物的浓度为0.2~3μM,所述下引物的浓度为0.2~3μM。
5.根据权利要求1~4任一项所述的荧光检测试剂盒,其特征在于,所述荧光检测试剂盒中还包含分子量内标。
6.根据权利要求1~5任一项所述的荧光检测试剂盒,其特征在于,所述荧光检测试剂盒中还包含PCR反应液、阳性对照样本和分型试剂;
优选地,所述分型试剂中使用的Ladder为Allelic Ladder。
7.一种如权利要求1~6任一项所述的荧光检测试剂盒的使用方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)以采集到的样本直接作为扩增模板或将采集到的样本进行纯化后得到的DNA作为扩增模板,配制得到反应体系后进行扩增;
(2)对扩增产物进行荧光检测,分析检测数据得到样本的基因分型。
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