[发明专利]蛋鸡NCS1基因中与后期产蛋性状相关的分子标记及其应用

说明书

本发明公开了蛋鸡NCS1基因中与后期产蛋性状相关的分子标记及其应用，所述分子标记位于NCS1基因的部分编码区，其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，共包括3个SNP位点，即第171bp、482bp和567bp处分别存在C/T、C/G和A/G三个等位基因突变位点，由其组成的单倍型组合可以作为蛋鸡后期产蛋性状相关的单倍型分子标记，其中单倍型组合H1H3：CCG/CGG的个体的60周龄产蛋数显著高于其他单倍型组合，通过对该单倍型组合的选取，有助于提高蛋鸡整体的后期产蛋数，即本发明为蛋鸡后期产蛋性状的标记辅助育种提供了一个新的分子育种标记，实现了对蛋鸡后期产蛋性状的筛选，且筛选方法简单快速。

技术领域

本发明涉及蛋鸡遗传标记筛选技术领域，具体涉及一种蛋鸡NCS1基因中与后期产蛋性状相关的分子标记及其应用。

背景技术

鸡蛋富含蛋白质、脂肪、卵磷脂等人体所需的多种营养物质，是我国居民饮食结构中的重要组成部分。产蛋后期是鸡群生产性能不断下降的阶段，产蛋后期占了整个产蛋期50％的时间，而且养殖生产中一般在500日龄左右的鸡群会被淘汰，但此时鸡群的产蛋率仍维持在60-70％，所有产蛋后期鸡群的生产性能直接影响蛋鸡养殖的经济效益。产蛋后期蛋鸡产蛋率下降的主要原因是产蛋后期卵巢衰老和机能减退，主要表现为卵泡数量减少、发育的优势卵泡闭锁率增加、卵泡发育受到抑制等，导致产蛋后期蛋鸡的利用期限缩短，经济价值降低，因此，提高产蛋后期蛋鸡产蛋率对于蛋鸡生产具有重要意义。

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphsim，SNP)是指基因组DNA序列中由于单个核苷酸(A、T、C或G)的突变而引起的多态性，包括单碱基的插入、缺失、转化和颠换等。全基因组关联分析(Gemome-Wide Association Study，GWAS)是应用基因组中数以百万计的SNP为分子遗传标记，进行全基因组水平的对照分析和相关分析。大量SNP标记的出现，使得以单个标记为中心的关联分析方法逐渐转变为以单倍型(haplotype)为主的关联分析方法。单倍型是指在同一染色体上或一定区域内若干个决定同一性状的且紧密相连锁的SNPs，具有统计学关联性。SNP标记及其组成的单倍型由于分布的广泛性和稳定性，在动物的分子标记辅助选择(Marker Assisted Selection，MAS)育种上发挥着重要作用，成为蛋鸡产蛋后期性状尤其是限性性状遗传改良的可行性技术。基于此，进一步鉴定与蛋鸡经济性状相关的SNP标记及其单倍型组合，进而借助SNP标记及其单倍型组合序列作为筛选标记用于优良蛋鸡经济性状的辅助选择上，将大大提高选种的准确性，对于培育具有优良经济性状的蛋鸡品种具有一定的意义。

神经元钙传感器1(Neuronal Calcium Sensor 1，NCS1)是一种高度保守的钙结合蛋白，参与多种生理细胞功能，包括胞吐作用、钙通透通道的调节、神经可塑性和对神经元损伤的反应。已有研究表明NCS1在脂肪细胞功能中起重要作用，NCS1缺乏会导致成年小鼠肥胖和2型糖尿病；NCS1表达改变与神经发育和神经退行性疾病有关；可通过促进细胞存活和转移促进肿瘤的侵袭性等等。然而，关于NCS1基因在蛋鸡上的研究却未见报道，迄今为止，尚无有关蛋鸡NCS1基因作为蛋鸡后期产蛋性能的分子标记的研究。

发明内容

本发明的目的在于提供了一种蛋鸡NCS1基因中与后期产蛋性状相关的分子标记及其应用，本发明首次发现了蛋鸡的NCS1基因的部分编码区中与后期产蛋性能相关的单倍型分子标记，这为蛋鸡后期产蛋性状辅助选择提供了重要参考依据。

本发明的目的之一在于提供一种蛋鸡NCS1基因中与后期产蛋性状相关的分子标记，所述分子标记的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:1所示，所述分子标记包括：

SNP1位点：在SEQ ID NO:1所示序列中第171bp处存在C/T多态性位点；

SNP2位点：在SEQ ID NO:1所示序列中第482bp处存在C/G多态性位点；