[发明专利]一种基于CovSegNet的肺部病变图像分割方法在审
申请号: | 202110301557.9 | 申请日: | 2021-03-22 |
公开(公告)号: | CN113052857A | 公开(公告)日: | 2021-06-29 |
发明(设计)人: | 王小华;潘晓光;焦璐璐;张娜;张雅娜 | 申请(专利权)人: | 山西三友和智慧信息技术股份有限公司 |
主分类号: | G06T7/11 | 分类号: | G06T7/11;G06T7/00;G06T5/00;G06T3/60;G06T3/40;G06N3/08;G06N3/04;G06K9/62;G06K9/42 |
代理公司: | 太原荣信德知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 14119 | 代理人: | 杨凯;连慧敏 |
地址: | 030006 山西省*** | 国省代码: | 山西;14 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 covsegnet 肺部 病变 图像 分割 方法 | ||
1.一种基于CovSegNet的肺部病变图像分割方法,其特征在于:包括下列步骤:
S100、数据采集:采集来自肺部感染的多种数据集,对获取的数据集中的图像进行数据标注,构建模型训练所需数据集;
S200、数据预处理:对数据划分,归一化和图像缩放,并且进行数据扩充;
S300、模型构建:基于CovSegNet的分割网络模型,输入训练数据,搭建参数模型;
S400、模型保存:保存损失函数不再降低之后的模型;
S500、模型评估:通过多种评价指标对保存的模型进行评估,了解其相关性能。
2.根据权利要求1所述的一种基于CovSegNet的肺部病变图像分割方法,其特征在于:所述S100数据采集中,采集20个CT卷,1800+切片形成数据集-1,且由放射学专家进行图像标注,然后从40名不同的COVID-19患者采集110幅轴向CT图像形成COVID-19CT分割数据集-2。
3.根据权利要求1所述的一种基于CovSegNet的肺部病变图像分割方法,其特征在于:所述S200数据预处理中,统一将两个数据集中的图像大小调整为512×512。
4.根据权利要求1所述的一种基于CovSegNet的肺部病变图像分割方法,其特征在于:所述S200数据预处理中,分别对训练集数据进行45度,90度,135度旋转,并调整数据对比度、亮度,对数据进行扩增,然后将进行变换后的数据与原训练集混合,构建新的数据集。
5.根据权利要求1所述的一种基于CovSegNet的肺部病变图像分割方法,其特征在于:所述S200数据预处理中,使用五折交叉验证法将数据集D划分为5个大小相似的互斥子集,然后用4个子集的并集作为训练集,余下的子集作为测试集,获得5组训练/测试集,然后进行5次训练和测试,最终返回到5个测试结果的均值。
6.根据权利要求1所述的一种基于CovSegNet的肺部病变图像分割方法,其特征在于:所述S200数据预处理中,对所有数据进行每个像素点除以225的归一化操作,统一量纲。
7.根据权利要求1所述的一种基于CovSegNet的肺部病变图像分割方法,其特征在于:所述S300模型构建中,将CT图像的分割成两个后续阶段,在训练的第一阶段中将在CovSegNet架构的二维变体中进行基于二维切片的优化过程用于提取CT切片中感染病灶的分割掩膜,优化后,采用阈值法将预测概率掩码转换为二进制掩码,然后从输入的CT体积中提取若干二维切片,利用预先训练好的CovSegNet2D提取肺部病变的概率掩模,然后将其聚合,生成去除大部分冗余部分的ROI增强CT体积,再将CovSegNet的3D变体投入操作,结合层内和层间的背景特征对ROI增强,对CT体积进行进一步处理;然后在训练的第二阶段中对该CovSegNet3D进行训练和优化,以生成3D体积概率掩模,引入切片间处理,同时对第一阶段获得的预训练CovSegNet2D进行微调,生成ROI增强的切片。
8.根据权利要求1所述的一种基于CovSegNet的肺部病变图像分割方法,其特征在于:所述S400模型保存中,首先使用Focal Tversky损失函数对模型进行计算,然后将CovSegNet2D和CovSegNet3D分割模型的目标损失函数表示为ζ2D=L(y,yP);ζ3D=L(Y,YP);之后将分段与体积相结合形成联合优化目标损失函数用于图像分割。
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