[发明专利]一种牛FRAS1基因插入/缺失突变的检测方法及其应用有效
申请号: | 202110302857.9 | 申请日: | 2021-03-22 |
公开(公告)号: | CN112795667B | 公开(公告)日: | 2023-05-26 |
发明(设计)人: | 蓝贤勇;李洁;宋恩亮;赵海谕;姜富贵;潘传英;赵佳宁;费攀锋;王勇胜;陈宏 | 申请(专利权)人: | 西北农林科技大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858 |
代理公司: | 西安通大专利代理有限责任公司 61200 | 代理人: | 范巍 |
地址: | 712100 陕*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 种牛 fras1 基因 插入 缺失 突变 检测 方法 及其 应用 | ||
1.牛FRAS1基因NC_037333.1:g.340433-340447位15-bp CTAAACAAAAACAAC缺失突变位点在牛分子标记辅助选择育种中的应用,其特征在于:所述牛FRAS1基因NC_037333.1:g.340433-340447位15-bp CTAAACAAAAACAAC缺失突变位点与牛的繁殖性状显著相关,其中,具有缺失/缺失基因型DD的个体在繁殖性状上较优;所述繁殖性状选自卵巢长、黄体个数中的一种或两种;所述牛为中国荷斯坦牛。
2.一种牛FRAS1基因插入/缺失多态性的检测方法在牛分子标记辅助选择育种中的应用,其特征在于:所述牛FRAS1基因插入/缺失多态性的检测方法包括以下步骤:
以待测牛基因组DNA为模板,利用PCR扩增包含FRAS1基因外显子区插入/缺失多态性位点的片段,将扩增产物进行电泳,根据电泳结果鉴定该插入/缺失多态性位点的基因型;所述插入/缺失多态性位点选自牛FRAS1基因NC_037333.1:g.340433-340447位15-bpCTAAACAAAAACAAC缺失突变位点;所述牛FRAS1基因NC_037333.1:g.340433-340447位15-bpCTAAACAAAAACAAC缺失突变位点与牛的繁殖性状显著相关,其中,具有缺失/缺失基因型DD的个体在繁殖性状上较优;
所述繁殖性状选自卵巢长、黄体个数中的一种或两种;
所述牛为中国荷斯坦牛。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于:所述PCR的扩增引物对为:
上游引物:5’-ACAGAATTCTCTCCAGAGCAATGAA-3’
下游引物:5’-CTGTCTTGGAAGAAACAGTGGC-3’。
4.根据权利要求2所述的应用,其特征在于:所述PCR采用的反应程序为:95℃预变性5min;94℃变性30s,68℃退火30s,72℃延伸20s,18个循环,每循环后退火温度减1℃;94℃变性30s,50℃退火30s,72℃延伸20s,25个循环;72℃延伸10min;所述电泳采用质量浓度为2.5%的琼脂糖凝胶。
5.根据权利要求2所述的应用,其特征在于:根据电泳结果,所述插入/缺失多态性位点有三个基因型,其中插入/插入基因型II表现为252bp一条带纹,插入/缺失基因型ID表现为252bp和237bp两条带纹,缺失/缺失基因型DD表现为237bp一条带纹。
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