[发明专利]一种牛ITGβ5基因插入/缺失突变的检测方法及其应用有效

专利信息
申请号: 202110304073.X 申请日: 2021-03-22
公开(公告)号: CN112941203B 公开(公告)日: 2023-05-26
发明(设计)人: 蓝贤勇;赵佳宁;李洁;宋恩亮;姜富贵;潘传英;费攀锋;王勇胜;赵海谕;陈宏;陈璟州;李雪峰 申请(专利权)人: 西北农林科技大学
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 西安通大专利代理有限责任公司 61200 代理人: 范巍
地址: 712100 陕*** 国省代码: 陕西;61
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摘要:
搜索关键词: 种牛 itg 基因 插入 缺失 突变 检测 方法 及其 应用
【权利要求书】:

1. 牛ITGβ5基因NC_037328.1:g.69192856-69192868位13-bp GTCAGATACGGGA缺失突变位点在牛分子标记辅助选择育种中的应用,其特征在于:所述牛ITGβ5基因NC_037328.1:g.69192856-69192868位13-bp GTCAGATACGGGA缺失突变位点的多态性与牛的繁殖性状显著相关;所述繁殖性状选自卵巢宽、黄体直径中的一种或两种,插入/插入基因型II的个体黄体直径更优,插入/缺失ID基因基因型的个体卵巢宽更优;所述牛为中国荷斯坦牛。

2.一种牛ITGβ5基因插入/缺失多态性的检测方法在牛分子标记辅助选择育种中的应用,其特征在于:所述牛ITGβ5基因插入/缺失多态性的检测方法包括以下步骤:

以待测牛基因组DNA为模板,利用PCR扩增包含ITGβ5基因插入/缺失多态性位点的片段,将扩增产物进行电泳,根据电泳结果鉴定该插入/缺失多态性位点的基因型;所述插入/缺失多态性位点选自牛ITGβ5基因NC_037328.1:g.69192856-69192868位13-bpGTCAGATACGGGA缺失突变位点;

所述牛ITGβ5基因NC_037328.1:g.69192856-69192868位13-bp GTCAGATACGGGA缺失突变位点的多态性与牛的繁殖性状显著相关;

所述繁殖性状选自卵巢宽、黄体直径中的一种或两种,插入/插入基因型II的个体黄体直径更优,插入/缺失ID基因基因型的个体卵巢宽更优;

所述牛为中国荷斯坦牛。

3. 根据权利要求2所述的应用,其特征在于:所述PCR的扩增引物对为:

上游引物:5’-GTTCCTGCTCAAGTCTCGGG-3’

下游引物:5’-CTTCCACTCTCACCCCCAAC-3’。

4. 根据权利要求2所述的应用,其特征在于:所述PCR采用的反应程序为:95 ℃预变性5 min;94 ℃变性30 s, 68 ℃退火30 s,72 ℃延伸20 s,18个循环,每循环后退火温度减1℃;94 ℃变性30 s,50 ℃退火30 s,72 ℃延伸20 s,25个循环;72 ℃延伸10 min;所述电泳采用质量浓度为2.5%的琼脂糖凝胶。

5. 根据权利要求2所述的应用,其特征在于:根据电泳结果,所述插入/缺失多态性位点有三个基因型,其中插入/插入基因型II表现为187 bp一条带纹,插入/缺失基因型ID表现为187 bp和174 bp两条带纹,缺失/缺失基因型DD表现为174 bp一条带纹。

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