[发明专利]一种金樱子三萜类化合物抗阿尔茨海默症的方法在审
申请号: | 202110311030.4 | 申请日: | 2021-03-24 |
公开(公告)号: | CN113178226A | 公开(公告)日: | 2021-07-27 |
发明(设计)人: | 高品一;张硕硕;司星星;童娟娟;李新新;刘学贵;李丹琦 | 申请(专利权)人: | 沈阳化工大学 |
主分类号: | G16B15/30 | 分类号: | G16B15/30;G16C20/50;G16C10/00;G16C20/90 |
代理公司: | 沈阳技联专利代理有限公司 21205 | 代理人: | 张志刚 |
地址: | 110142 辽宁*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 金樱子 三萜类 化合物 抗阿尔茨海默症 方法 | ||
1.一种金樱子三萜类化合物抗阿尔茨海默症的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤::
S1、金樱子中三萜类化合物库的建立
运用在线数据库(TCMSP和知网)筛选金樱子中分离得到的三萜类化合物名称和结构,利用画图软件画出所有化合物的2D结构,同时将筛选出的所有金樱子中分离出的三萜类化合物结构转化为对应的3D结构;
S2、阿尔茨海默症蛋白的准备
在Drug bank、uniport、RCSB PDB、OMIM数据库中,以“阿尔茨海默症”作为关键词检索查找,确定筛选条件,对蛋白进一步筛选,最后将满足条件的蛋白下载保存;
S3、分子对接
依次将S2中得到的阿尔兹海默症蛋白与S1中得到的所有小分子化合物进行对接,打分;将对接活性高的化合物予以保存;
S4、构建成分靶点-疾病靶点网络及筛选核心靶点
将运用STRING数据库分析S3中选中的化合物,得到靶点蛋白网络关系图(PPI网络);用软件分析网络节点的拓扑结构特征参数,建立金樱子三萜类化合物-阿尔茨海默症核心靶点图,筛选核心靶点并进行后续筛选分析;
S5、对核心靶点富集分析以探讨药物成分作用机制
利用R语言相关包对核心靶点进行GO生物过程和KEGG通路注释富集分析,输出相应图表,对照解析金樱子三萜类化合物-阿尔茨海默症的作用机制;
S6、“成分-靶点-疾病通路”网络构建
根据S5结果构建“药物-靶点-疾病通路”可视化图形;具体应用R语言中“pathview”包将KEGG富集通路的相关靶点映射到通路图,便于进行后续分析;
S7、进行体外活性验证
将网络药理学得到的金樱子三萜类化合物抗阿尔茨海默症的核心靶点以及相关化合物进行直接靶标实验,神经细胞保护活性验证,分子动力学模拟。
2.根据权利要求1所述的一种金樱子三萜类化合物抗阿尔茨海默症的方法,其特征在于,所述S3中分子对接筛选打分为score5。
3.根据权利要求1所述的一种金樱子三萜类化合物抗阿尔茨海默症的方法,其特征在于,所述S2中筛选条件为选择分辨率在3.00 Å以下,阿尔兹海默症,人源,含有配体。
4.根据权利要求3所述的一种金樱子三萜类化合物抗阿尔茨海默症的方法,其特征在于,所述配体不能是离子。
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