[发明专利]肉鸡腹脂率性状相关的分子标记APOA5 c.459及其应用

说明书

本发明公开了肉鸡腹脂率相关的分子标记APOA5c.459及其应用，涉及家禽遗传育种技术领域。本发明提供了一种与肉鸡腹脂率相关的SNPAPOA5c.459GA，其序列如SEQ ID NO:1所示。本发明还提供了检测所述SNP的特异性引物组和具体的检测方法，能够高效灵敏快捷的检测所述SNP序列，以筛选鉴定低腹脂率肉鸡品种。本发明的实施能够有效筛选低腹脂率肉鸡，为肉鸡的遗传育种提供了新的技术方案，适合在肉鸡养殖产业上大规模推广应用。

技术领域

本发明涉及家禽遗传育种技术领域，具体而言，涉及肉鸡腹脂率性状相关的分子标记APOA5 c.459及其应用。

背景技术

鸡肉独特风味的来源主要是肌内脂肪和皮下脂肪。一方面，肉品质指标中嫩度、多汁性源于肌内脂肪对肌肉纤维的溶解；另一方面，鸡肌内脂肪、皮下脂肪的脂质降解过程中，含量丰富的磷脂产生的香味，是组成鸡肉风味的重要部分，同时，肌肉中的不饱和脂肪酸在加热时发生氧化反应，氧化产物进一步分解为烯醛等挥发性物质，是鸡肉香味的重要组成成分。而我国多种著名的地方品种鸡，如北京油鸡、清远麻鸡、彭县黄鸡等具有的独特风味均来源于因一定程度的皮下脂肪和肌内脂肪沉积。但受限于鸡体内脂肪沉积规律，想达到一定程度的肌内脂肪的沉积往往难以避免大量的腹脂沉积，从而导致饲料报酬的下降，影响肉鸡生产的效益，如何解决肉鸡的过度脂肪沉积是肉鸡遗传育种中育种工作者相当重视的一个问题，也是提高黄羽肉鸡生产率的一个重要途径。

分子标记辅助选择(MAS)是一种常用的分子育种技术。MAS可以直接根据遗传物质的多态性进行相应的分析，如单核苷酸多态性(SNP)。分子标记辅助选择技术在其他家畜的育种中已有相当长的历史，与传统育种方法相比，MAS具有存在范围广、遗传稳定、直观准确等优点，目前并未大规模的应用于鸡的育种中。其原因一方面是对于鸡的经济性状的分子标记研究和挖掘较少，可应用于实际育种中选择重要经济性状的分子标记不足；另一方面是分子标记的检测往往成本较高，在世代间隔短，育种群体大的鸡育种中应用分子标记辅助选择技术的成本较常规育种方法更高。但随着更多低成本检测技术的发展以及分子标记的开发，分子标记辅助选择技术在鸡的育种中的应用成本显著降低，因此，进一步挖掘分子水平上与鸡重要经济性状相关的候选基因，通过对其多态性的研究并建立相关分子遗传标记，可以有效推动优质鸡的育种工作。

发明内容

本发明的目的在于克服现有技术的缺陷，提供肉鸡腹脂率相关的分子标记APOA5c.459及其应用。根据APOA5基因的已知序列，利用直接测序，寻找与黄羽肉鸡腹脂率关联的SNP位点，并通过飞行时间质谱分析对SNP分型结果与群体性状进行关联分析，从而获得与黄羽肉鸡腹脂率关联的分子标记，为鸡的标记辅助选择提供新的分子标记资源。

为实现上述目的，提供了如下方案：

第一方面，提供了一种与肉鸡腹脂率相关的分子标记APOA5 c.459GA，其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，所述序列的第95位碱基处是G或A(即碱基G与碱基A发生替换)。

第二方面，提供了检测分子标记APOA5 c.459GA的引物组，所述引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO.2-3所示。

第三方面，提供了所述分子标记或检测所述分子标记的试剂在筛选低腹脂率肉鸡中的应用。

在一些实施方案中，检测所述分子标记的试剂中包括检测所述分子标记的特异性引物组。

在一些实施方案中，检测所述分子标记的特异性引物组为本发明所述的引物组。

第四方面，提供了一种利用分子标记APOA5 c.459GA筛选低腹脂率肉鸡的方法，包括以下步骤：

(a)提取待检测鸡的DNA；

(b)目的片段的获得及测序：利用能够扩增所述分子标记序列的引物组对通过PCR扩增待检测鸡的DNA，将获得的产物进行测序，分析序列碱基；