[发明专利]一种基于卷积神经网络的脑胶质瘤MRI图像分割方法有效
申请号: | 202110314057.9 | 申请日: | 2021-03-24 |
公开(公告)号: | CN113012168B | 公开(公告)日: | 2022-11-04 |
发明(设计)人: | 李东洁;张宇婷 | 申请(专利权)人: | 哈尔滨理工大学 |
主分类号: | G06T7/11 | 分类号: | G06T7/11;G06T5/40;G06T5/50;G06N3/08 |
代理公司: | 哈尔滨市松花江专利商标事务所 23109 | 代理人: | 岳泉清 |
地址: | 150080 黑龙*** | 国省代码: | 黑龙江;23 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 卷积 神经网络 胶质 mri 图像 分割 方法 | ||
1.一种基于卷积神经网络的脑胶质瘤MRI图像分割方法,其特征在于,该方法包括如下步骤:
步骤一:利用直方图均衡化方法对脑胶质瘤MRI图像数据进行处理,对图像数据进行中心裁剪,并对图像进行归一化,归一化后对图像切成64*64*64的块;
步骤二:对三维卷积神经网络模型进行搭建,采用编码-解码结构;
编码结构;
将网络的输入分为四个通道,分别输入病人四个模态的脑胶质瘤MRI图像数据,将每个模态的数据分别进行特征的提取,在每一层相同的卷积层,将四个模态学习到的特征进行融合,通过残差连接,输出到解码结构对应的卷积层中;
解码结构:
利用双线性插值方法,此部分的每一层卷积层,不会接收来自上一层的特征信息,会接收来自编码部分对应卷积层四个模态特征的融合,并将特征进一步进行融合;
步骤三:对模型的训练与分割;
将模型放在Nvidia1080TiGPU上进行训练,训练完成后进行测试并标注,并对图像进行分割。
2.如权利要求1所述的一种基于卷积神经网络的脑胶质瘤MRI图像分割方法,其特征在于,所述的步骤二的具体过程为:
对三维卷积神经网络模型进行搭建,采用编码-解码结构,在卷积神经网络模型中,每个卷积块包括2-3组卷积层、激活函数和实例归一化的组合,激活函数采用泄露修正线性单元,左半部分梯度部位0,输入值落在此半部分,泄漏率为10-2,泄露修正线性单元表达如下:
式中:xi----代表每一个输入数据;
a-----代表泄漏率;
每一个卷积块的后面加入了一个Dropout层;
m是一个输入样本的数量,xi代表每一个输入数据,xi经过归一化后得到yi是将输出归一化后得到的结果,代表方差,μB代表均值,β代表偏移参数,γ代表缩放参数,首先计算当前一个Batch中输入的平均值μB和接着将每一个输入特征xi进行标准归一化,再利用偏移参数β和缩放参数γ对标准化的输入进行作用得到最终结果:
训练时,前向传播过程中模型会保存当前Batch的均值μB和方差输出不改变;后向传播过程中会结合保存的均值μB和方差进行链式求导,根据计算得到的梯度确定当前的学习率。
3.如权利要求2所述的一种基于卷积神经网络的脑胶质瘤MRI图像分割方法,其特征在于,所述的步骤三的具体过程为:将模型放在Nvidia1080TiGPU上进行训练,训练完成后进行测试并标注,并对图像进行分割,其权重设为背景:坏死核:水肿:增强型脑胶质瘤等于1:5:2:3,将标准标注分为四类,标签0代表背景,标签1代表坏死核和非增强型胶质瘤,标签2代表瘤周水肿,标签4代表增强型胶质瘤,4种标签根据划分代表胶质瘤的三个亚区,(1)全部胶质瘤;(2)胶质瘤核心区,由坏死组织、非增强胶质瘤和增强胶质瘤组成;(3)胶质瘤增强区,仅有增强型胶质瘤组成。
4.如权利要求3所述的一种基于卷积神经网络的脑胶质瘤MRI图像分割方法,其特征在于,所述的步骤一中对图像数据进行中心裁剪,裁剪的大小为224*224*155。
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