[发明专利]一种高粱籽粒单宁新基因tan1-d及高通量检测标记

权利要求书

1.一种高粱籽粒单宁基因tan1-d，其特征在于：位于高粱第4号染色体上的基因Tannin1编码区+659核苷酸位点，即220aa处发现一个12bp的缺失，所述12bp的缺失是缺少TCGTCTACGAGA，而含有单宁的野生型品种含有上述12个碱基；所述12bp的缺失导致Tannin1基因编码的蛋白第3个与第4个WD40结构域之间少了4个氨基酸，从而造成Tannin1基因功能的丧失，高粱籽粒没有单宁；

所述tan1-d的核苷酸序列如SEQ ID NO.17所示。

2.根据权利要求1所述基因在检测高粱籽粒中有无单宁控制基因Tannin1编码区内单宁丧失变异的应用，其特征在于：利用分子标记和提取的基因组DNA进行PCR扩增，并在LGCSNPline荧光信号检测系统上进行SNP检测；判定的标准以点的颜色和聚集在横轴或纵轴的位置决定：信号为红色，聚集在纵轴附近且与tan1-d对照聚集在一起，判定为tan1-d基因型；信号为蓝色，与横轴和野生型Tan1对照聚集在一起，判定为Tan1基因型；

所述扩增分子标记的引物包含2个KASP正向引物和一个共同的反向引物，所述正向引物为tan1-d-KASP-FAM和tan1-d-KASP-HEX；反向引物为tan1-d-KASP-R，引物序列分别如SEQ ID NO.3-5所示；所述分子标记检测位点处的基因型分别为T和G。

3.根据权利要求1所述基因在高粱单宁育种中的应用。