[发明专利]鉴定万寿菊舌状花花瓣裂片性状的SCAR分子标记、检测引物及其应用

说明书

本发明公开了鉴定万寿菊舌状花花瓣裂片性状的SCAR分子标记、检测引物及其应用。所述SCAR分子标记在万寿菊舌状花瓣无裂片的核苷酸序列为SEQ ID NO.1所示，其在万寿菊舌状花瓣有裂片的核苷酸序列为SEQ ID NO.2所示。本发明进一步提供了鉴定万寿菊舌状花花瓣裂片性状的检测引物和检测试剂盒。采用本发明提供的SCAR分子标记能准确高效区分万寿菊的舌状花花瓣裂片有无，其在万寿菊舌状花花瓣裂片有无的F2分离群体中检测效率达96.12％，能够直接利用PCR产物快速筛选万寿菊舌状花花瓣裂片有无的性状，能够在苗期对万寿菊进行选择，显著提高育种效率并降低育种成本。

技术领域

本发明涉及植物品质性状的分子标记，尤其涉及鉴定万寿菊舌状花花瓣裂片性状的SCAR标记、检测引物及其应用，属于万寿菊舌状花花瓣裂片性状的SCAR分子标记领域。

背景技术

花对称性是定义花序类型的主要因素，也是被子植物所具有的典型特征。根据对称面数量的不同，可以将花序对称类型分为辐射对称、两侧对称和不对称三类。两侧对称由辐射对称进化而来，能够有效地吸引传粉者，促进植物花粉传播。在向日葵、金鱼草和非洲菊中均有报道利用突变体挖掘影响花瓣对称性的相关关键基因，为揭示对称性发育提供极高参考价值。

万寿菊(Tagetes erecta)为菊科一年生花卉，其头状花序由外围两侧对称的舌状花和内部辐射对称的管状花组成。华中农业大学万寿菊课题组前期获得突变体株系‘JH’，其两侧对称的舌状花瓣转变为辐射对称的管状花瓣，即原本无裂的花瓣具有五个裂片，这对于探究花序对称性分子机理有重大研究意义。

随着生活水平的提高和对精神文化需求的增加，消费者对花卉的观赏特性要求越来越高。舌状花花瓣具有裂片的性状能够提高万寿菊的观赏特性，增强万寿菊的市场价值，满足大众需求。虽然万寿菊花瓣裂片的有无很容易在盛花期辨认，但无法在花发育早期分辨，大大提高花卉培育成本。目前，还没有对万寿菊舌状花花瓣裂片有无相关基因进行遗传定位的研究。

BSA分析法是利用具有极端性状的F2群体，快速定位控制目标性状基因的方法。BSR-seq是通过第二代测序技术和RNA-seq进行混合群体分析(BSR)，利用测序结果开发SNP分子标记，精确定位目标基因的方法。玉米、小麦、水稻等植物均已利用BSR-seq技术成功定位与目标性状紧密连锁的目标基因。将BSR-seq与比较基因组学相结合，利用向日葵基因组和万寿菊第三代转录组，开发与万寿菊舌状花花瓣形态紧密连锁的分子标记，能够在苗期对万寿菊进行选择，提高育种效率。

发明内容

本发明的目的之一是提供一种鉴定万寿菊舌状花花瓣裂片性状的SCAR分子标记；

本发明的目的之二是提供扩增所述分子标记的检测引物；

本发明的目的之三是将所述的分子标记或检测引物应用于鉴定万寿菊舌状花花瓣裂片性状。

本发明的上述目的是通过以下技术方案来实现的：

本发明首先提供一种鉴定万寿菊舌状花花瓣裂片性状的SCAR标记，将其命名为T01.PB37003，其在万寿菊舌状花瓣无裂片的核苷酸序列为SEQ ID NO:1所示，其在万寿菊舌状花瓣有裂片的核苷酸序列为SEQ IDNO:2所示。

本发明提供的SCAR分子标记T01.PB37003在舌状花花瓣无裂片的万寿菊序列中，156bp后存在一段203bp的插入序列，本发明对比了大量万寿菊品种的SCAR标记T01.PB37003，结果证明其与舌状花花瓣裂片性状紧密连锁，显示本发明提供的特异性分子标记T01.PB37003可用来鉴定万寿菊舌状花花瓣裂片有无。

本发明进一步提供了检测所述SCAR分子标记T01.PB37003的检测引物。

作为一种优选的实施方案，所述的检测引物由SEQ ID NO.3所示的上游检测引物和SEQ ID NO.4所示的下游检测引物组成。