[发明专利]与花生抗黄曲霉菌侵染主效QTL位点qPSIIB10连锁的SNP分子标记及其应用有效
申请号: | 202110381706.7 | 申请日: | 2021-04-09 |
公开(公告)号: | CN112980993B | 公开(公告)日: | 2022-04-08 |
发明(设计)人: | 廖伯寿;罗怀勇;雷永;黄莉;刘念;晏立英;康彦平;姜慧芳;蒋艺飞 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院油料作物研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 孙怡 |
地址: | 430062 湖北省武汉市武昌*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 花生 黄曲霉菌 侵染 qtl qpsiib10 连锁 snp 分子 标记 及其 应用 | ||
本发明涉及分子标记技术领域,具体涉及与花生抗黄曲霉菌侵染主效QTL位点qPSIIB10连锁的SNP分子标记及其应用。本发明的与花生抗黄曲霉菌侵染主效QTL位点连锁的SNP分子标记包括:qPSIIB10‑L或qPSIIB10‑R。其中,SNP分子标记qPSIIB10‑L含有如SEQ ID NO.1所示序列第235位的多态性为C/T和第338位的多态性为G/A的核苷酸序列;SNP分子标记qPSIIB10‑R含有如SEQ ID NO.2所示序列的第297位的多态性为G/A的核苷酸序列。本发明可以辅助选择花生种仁抗黄曲霉菌侵染的材料,有利于促进花生抗黄曲霉新品种的选育和应用。
技术领域
本发明涉及分子标记技术领域,具体涉及与花生抗黄曲霉菌侵染主效QTL 位点qPSIIB10连锁的SNP分子标记及其应用。
背景技术
花生(Arachis hypogea L.)是重要的油料作物之一。花生种子含有丰富的食用油脂、蛋白质、氨基酸和维生素,可以加工为食用油、坚果、花生酱等食品。然而,在花生生产和收获后,花生都有可能受到黄曲霉菌(Aspergillus flavus)的侵染,产生黄曲霉毒素,严重破坏花生的品质。因此,如何减少黄曲霉菌对花生种子的侵染、控制黄曲霉毒素的危害,是花生产业发展的重大需求。
选育和利用抗病品种是防治作物病害最为经济有效的措施之一。研究发现,部分花生种质荚壳和种仁对黄曲霉菌侵染存在抗性,部分种质的种仁对黄曲霉菌产毒具有抗性。整合这三类抗性是花生遗传改良研究的重要方向之一。
花生对黄曲霉菌的抗性表型为多基因控制的数量抗性。数量性状易受环境条件的影响,因此对表型直接进行选择的效果不好。通过构建高密度遗传连锁图谱,对分子标记基因型和表型进行QTL分析,可以将复杂的数量性状分解成多个QTL,利用与QTL连锁的分子标记可以进行分子标记辅助选择,提高育种效率。
目前对花生种仁抗黄曲霉菌侵染的QTL定位研究还较少,检测到的主效 QTL数目更少,难以在花生育种中应用。
发明内容
本发明针对现有技术的不足,目的在于提供一个抗黄曲霉菌侵染主效QTL 位点qPSIIB10的SNP标记、SNP标记引物对、SNP标记检测方法及其应用。
具体地,本发明提供如下技术方案:
第一方面,本发明提供与花生抗黄曲霉菌侵染主效QTL位点qPSIIB10连锁的 SNP分子标记,其包括qPSIIB10-L或qPSIIB10-R;
其中,SNP分子标记qPSIIB10-L含有如SEQ ID NO.1所示序列第235位的多态性为C/T和第338位的多态性为G/A的核苷酸序列;SNP分子标记qPSIIB10-R含有如SEQ ID NO.2所示序列的第297位的多态性为G/A的核苷酸序列。
所述SNP分子标记qPSIIB10-L对应的两个SNP位点及其侧翼序列如SEQ ID NO.1所示;所述SNP分子标记qPSIIB10-R对应的一个SNP位点及其侧翼序列如 SEQ ID NO.2所示。
所述SNP分子标记qPSIIB10-L中,具有第235位多态性位点的基因型为T 且第338位多态性位点的基因型为A,对应于含有抗黄曲霉菌侵染主效QTL位点qPSIIB10,具有第235位多态性位点的基因型为C且第338位多态性位点的基因型为G,对应于不含有qPSIIB10;所述SNP分子标记qPSIIB10-R中,具有第297位多态性位点的基因型为A,对应于含有qPSIIB10,基因型为G,对应于不含qPSIIB10。
第二方面,本发明提供与花生抗黄曲霉菌侵染主效QTL位点qPSIIB10连锁的SNP分子标记组合,其包括qPSIIB10-L和qPSIIB10-R;其中,SNP分子标记qPSIIB10-L和qPSIIB10-R如上所述。
第三方面,本发明提供用于扩增上述SNP分子标记或SNP分子标记组合的引物。
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