[发明专利]用于SCA亚型基因检测的引物对、试剂盒及检测方法

说明书

本申请属于分子生物学技术领域，具体公开了用于SCA亚型基因检测的引物对、试剂盒及其检测方法。该引物对包括针对ATXN1的引物对1、针对ATXN2的引物对2、针对ATXN3的引物对3、针对CACNA1A的引物对4和针对ATXN7的引物对5中的一种或多种。本申请至少具有以下有益效果之一：本申请提供的引物对1、引物对2、引物对3、引物对4和引物对5，能够准确地检测出SCA相关的ATXN1、ATXN2、ATXN3、CACNA1A、ATXN7基因中CAG的重复状况，且引物对特异性高，准确率高，CAG重复数误差约为正负1次。

技术领域

本申请属于分子生物学技术领域，更具体地说，它涉及一种用于SCA亚型基因检测的引物对、试剂盒及其检测方法。

背景技术

脊髓小脑共济失调（SCA）是一组表现为高度临床异质性和遗传异质性的常染色体显性遗传性神经系统疾病，主要表现为进行性加重的肢体共济失调，构音障碍、眼球运动障碍等。SCA的发病分子基础主要是动态突变，即疾病基因中的CAG端串联重复序列拷贝数发生不稳定的持续扩增，使得其编码异常的含多聚谷氨酰胺的蛋白，最终导致细胞凋亡、神经元变性。SCA各型之间发病年龄差异不大，临床症状相互重叠，因此临床分型确认较为困难，且与亨廷顿舞蹈症、多系统萎缩（MSA）等神经肌肉疾病鉴别诊断有一定难度。

目前临床根据病史、体征、家族史、影像学特征进行疾病诊断，具体分型则需要进行基因检测。针对脊髓小脑共济失调尚无特异性的治疗方法，主要为对症治疗，因此基因检测不仅有助于确认患者SCA亚型，还可对患者的家成员进行症状前诊断，早期临床干预，并为产前诊断提供基础。

按照基因型分类，迄今为止共发现SCA1～26等若干亚型。流行病学数据显示，SCA3（ATXN3）是最常见的亚型，约占54.6-72.5%，其次为SCA1（ATXN1），约为5.9%，SCA2（ATXN2）约为5.7-6.7%，SCA6（CACNA1A）和SCA7（ATXN7）分别占1.6-3.3%和0.8-4.8%，目前我国尚未检出SCA8、SCA10、SCA17等亚型，因此，SCA3、SCA1、SCA2、SCA6和SCA7亚型约占70-80%，因此，这五种分型的检测对于临床用药具有重要的指导意义。

发明内容

本申请的发明人发现由于CAG重复数检测实验难度较大，且不同亚型涉及的基因特点不一，目前已有的检测SCA方法均是针对SCA单一亚型进行检测。患者在进行亚型确认时，需对不同亚型相关基因进行逐一检测，实验操作过程繁杂，耗时较长。且目前多数CAG检测方法采用PCR结合琼脂糖凝胶电泳的检测方法，通过电泳结果对CAG重复进行估算，估值存在一定误差。因此，本申请目的之一在于，提供针对SCA3、SCA1、SCA2、SCA6和SCA7亚型检测的引物，进而减少误差，提高准确率。

本申请是通过以下方案实现的：