[发明专利]长链非编码RNA TCONS00026679在ALL白血病中的应用

说明书

本发明公开了长链非编码RNA TCONS_00026679在ALL白血病中的应用。具体的，通过对ALL白血病样品以及正常骨髓样品进行基因芯片测序，发现ALL白血病中长链非编码RNA，TCONS_00026679显著高表达。高表达的TCONS_00026679与病人八年生存率显著相关，而长链非编码RNA TCONS‑_00026679在B‑ALL和T‑ALL中的表达具有显著差异性，可用于B‑ALL和T‑ALL白血病分型的区分和鉴定，长链非编码RNA TCONS_00026679可作为诊断标记物和/或治疗靶点在制备ALL白血病诊断和分型产品发挥作用。

技术领域

本发明涉及生物医药技术领域技术领域，具体涉及长链非编码RNA TCONS_00026679在ALL白血病中的应用。

背景技术

急性淋巴细胞白血病（Acute lymphoblastic leukemia，ALL）是儿童最常见的恶性肿瘤，同时也是导致儿童因癌症死亡的主要原因。急性淋巴细胞白血病可以分为B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）和T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）。虽然近些年来，儿童治疗方案的不断优化和应用大大提高了患者的5年生存率，但是仍有15%的儿童因为肿瘤的复发或难治性导致其预后较差。因此，迫切需要寻找新的生物标志物，用于早期诊断和预后评估以及药物靶标，以提高儿童ALL的整体治疗效果。

长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）是长度大于200个核苷酸的RNA分子，在肿瘤等多种疾病发生过程中发挥着重要的作用。许多研究表明，异常表达的lncRNA可以在转录水平、转录后水平以及翻译水平等各方面调节基因的表达，从而导致乳腺癌、肝癌、胰腺癌和结直肠癌等癌症的发生发展。据报道，在儿童白血病中，lnc-THADA-4、lnc-ACOT9-1和lnc-NRIR可能可以作为粒单细胞白血病的新的治疗靶标。有研究表明Lnc-CCDC26、 lnc-DARS-AS1和lnc-SNHG14在儿童急性髓系白血病中发挥癌基因的作用。此外，有lncRNA基因表达谱研究表明，有些lncRNA与儿童ALL相关，并有望作为新的分子标志物。最近，部分lncRNA也被证明与儿童ALL的发病机制、预后以及治疗效果有关。然而儿童ALL的详细机制很大程度上都是未知的。

发明内容

为了克服现有技术中存在的缺点和不足，本发明的目的在于提供长链非编码RNATCONS_00026679作为诊断标记物在制备ALL白血病诊断产品中的应用。

本发明的另一目的在于提供长链非编码RNA TCONS_00026679作为治疗靶点在筛选或制备用于治疗儿童ALL白血病药物中的应用。

本发明的目的通过下述技术方案实现：本发明发现一个在ALL白血病中特异性高表达，而在正常生理条件下低表达的lncRNA，TCONS_00026679。TCONS_00026679的基因座位为人第18号染色体的反义DNA链上，其基因覆盖从12739784bp到12749484bp的范围，可以转录出长度为338 nt的lncRNA，其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。

本发明通过对ALL白血病样品以及正常骨髓样品进行基因芯片测序，发现一个在ALL白血病中特异性高表达的lncRNA，TCONS_00026679。进一步地，在B-ALL和T-ALL白血病和正常样品中进行qRT-PCR验证，结果发现TCONS_00026679在B-ALL和T-ALL中的表达具有显著差异性，说明TCONS_00026679可以用于B-ALL和T-ALL白血病分型的区分和鉴定。

进一步，利用ROC曲线分析证实，TCONS_00026679能够显著地区分B-ALL白血病和T-ALL白血病病人样品；生存曲线分析得出高表达的TCONS_00026679八年生存率显著升高，预示着TCONS_00026679具有作为儿童ALL白血病的分类器及预后指示器的潜在临床作用。