[发明专利]用于乳腺癌遗传筛查的基因及其应用

说明书

本发明公开了一组用于乳腺癌遗传筛查的基因，本发明还公开了用于捕获上述基因的试剂盒。试剂盒中包含捕获RECQL4基因的探针，所述探针的捕获区域为染色体编号：chr8；区域位置：144511288‑144517833；区域：外显子区域及外显子内含子交接区域。通过检测该RECQL4基因是否突变，可以识别人群中患乳腺癌的风险。从而使得乳腺癌易感人群能够提前得知患癌风险，有较好的临床指导意义。同时，RECQL4基因突变患者突变压显著提升，由于突变压是免疫治疗预后好的一个重要标志物，提示RECQL4基因突变乳腺癌患者可能从免疫治疗中获益。

技术领域

本发明属于生物技术领域，涉及一个针对高侵袭性肿瘤进行分子分型的基因，及该基因在预判高侵袭性肿瘤的发生和转移风险中的应用。

背景技术

癌症被认为是世界上每个国家的主要死亡原因和延长预期寿命的重要障碍。根据世界卫生组织(WHO)2019年的估计，在183个国家中，有112个国家中，癌症是年龄小于70岁人类中数一数二的死亡原因，在另外23个国家中癌症的致死率排名第三或第四。癌症作为主要死亡原因的重要性进一步上升。据2020的统计，女性乳腺癌的发生率已经超过肺癌，成为全球范围内最高频发生的癌症类型，在新发的1930万癌症患者中，女性乳腺癌的发生率为11.7％。乳腺癌是全球癌症死亡的第五大原因，2020年有685,000例死亡。在女性中，乳腺癌占四分之一的癌症病例，占六分之一的癌症死亡，在绝大多数国家(185个国家中的159个)的发病率中排名第一，在110个国家中的死亡率中排名第一。

在许多欧美国家中，乳腺癌的发病率在1980年代和1990年代期间迅速增加，然后，在2000年代初，发病率趋于下降或稳定，这在很大程度上归因于更年期激素疗法的使用减少以及筛查参与的平稳期。自2007年以来，欧美国家的发病率呈缓慢上升。欧美国家利用癌症患者随访信息和肿瘤分子标志，发现2007年后新增加的发病率仅限于雌激素受体阳性的癌症，而雌激素受体阴性的癌症的发病率正在下降。因此，随着检测技术的提升，对乳腺癌的检出率也会提升。在我国乳腺癌的发生率同样为第一，但是在我国乳腺癌的致死率低于肺癌。据2015年中国注册的癌症患者信息，约有15％的新发癌症患者为乳腺癌。

乳腺癌是一种高度异质性疾病，致病因素包括遗传因素、激素水平和环境因素等。约有10％-15％的癌症患者具有家族遗传史。随着高度外显肿瘤易感基因BRCA1和BRCA2的鉴定，针对BRCA1和BRCA2基因的遗传筛查，促进了乳腺癌遗传风险评估和控制。虽然针对乳腺癌的基因筛查已经逐渐变成常规的临床检测方案，但是，目前针对乳腺癌的基因筛查基因只包括少数基因，极大的限制了对肿瘤易感性的评估。

发明内容

本发明针对非BRCA1/2突变的乳腺癌患者遗传筛查，提供了一个用于评估乳腺癌患癌风险的基因及其检测试剂盒。

本发明提供一个用于乳腺癌患癌风险预测的基因，该基因为RECQL4基因。

本发明提供一种用于乳腺癌患癌风险和乳腺癌预后分析的检测试剂盒，所述检测试剂盒包括捕获本发明所述RECQL4基因的探针。

其中，所述的检测试剂盒较佳地还包括：基因组DNA提取试剂、文库构建试剂、二代测序试剂，选自末端修复酶、末端修复反应缓冲液、DNA连接酶、连接反应缓冲液、含分子标签的接头、文库扩增引物、PCR预混液、接头封闭剂、DNA封闭剂、杂交缓冲液、杂交增强剂、磁珠洗液、杂交洗液、捕获文库PCR引物、质控品、核酸纯化磁珠和链霉亲合素磁珠的一种或多种试剂。

其中，所述基因组DNA提取试剂为本领域常规的基因组DNA提取试剂。

其中，所述文库构建试剂和二代测序试剂为本领域常规使用的试剂，只要能满足对所得序列构建文库并进行二代测序的要求即可。所述的二代测序为本领域常规的二代测序。

本发明所述的检测试剂盒较佳地还包括从检测对象提取检测样本的器械；更佳地，还包括从检测对象或肿瘤患者体内提取组织或血液的器械，所述器械较佳地为任何能用于取血的釆血针、注射器等。