[发明专利]一种用于检测肌酸激酶同工酶的滚环扩增-金四面体比色检测方法和试剂盒有效
申请号: | 202110402479.1 | 申请日: | 2021-04-14 |
公开(公告)号: | CN113265447B | 公开(公告)日: | 2022-06-21 |
发明(设计)人: | 高志贤;王瑜;彭媛;李双;韩殿鹏;任舒悦;秦康;韩铁;张靖扬 | 申请(专利权)人: | 军事科学院军事医学研究院环境医学与作业医学研究所 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844;C12Q1/50;G01N21/31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 肌酸激酶 扩增 四面体 比色 方法 试剂盒 | ||
1.一种用于检测肌酸激酶同工酶的滚环扩增-金四面体比色检测试剂盒,包括以下组分:
(1)磁珠-适配体-互补链复合物,其制备方法包括:将链霉亲和素化的磁珠与生物素化的适配体相结合,振荡孵育,得到磁珠-适配体复合物;向磁珠-适配体复合物中加入互补链,振荡孵育,得到磁珠-适配体-互补链复合物;
所述适配体的核苷酸序列为5’-GGGGGGTGGGTGGGGGATCTCGGAGGATGCTTTTAGGGGGTTGGG-3’(SEQ ID NO:1);
所述互补链的核苷酸序列为5’-AACCTAAGCATCTCGAGT-3’(SEQ ID NO:2);
(2)AuNPs四面体,其制备方法包括:将修饰了DNA四面体链的AuNPs两两混合,在缓慢降温过程中形成DNA二聚体,之后将二聚体混合,震荡孵育形成DNA四聚体;
所述DNA四面体链分别为:
DNA1: 5’-TTTGCCTGGAGATACATGCACATTACGGCTTTCCCTATTAGAAGGTCTCAGGTGCGCGTTTCGGTAAGTAGACGGGACCAGTTCGCCTTTTTTTTTTTTATTCAGATTCAGGACAGT-3’(SEQ ID NO:3)
DNA2: 5’-TTTCGCGCACCTGAGACCTTCTAATAGGGTTTGCGACAGTCGTTCAACTAGAATGCCCTTTGGGCTGTTCCGGGTGTGGCTCGTCGG-3’(SEQ ID NO:4)
DNA3: 5’-TTTGGCCGAGGACTCCTGCTCCGCTGCGGTTTGGCGAACTGGTCCCGTCTACTTACCGTTTCCGACGAGCCACACCCGGAACAGCCC-3’(SEQ ID NO:5)
DNA4: 5’-TTTGCCGTAATGTGCATGTATCTCCAGGCTTTCCGCAGCGGAGCAGGAGTCCTCGGCCTTTGGGCATTCTAGTTGAACGACTGTCGC-3’(SEQ ID NO:6)
所述修饰了DNA四面体链的AuNPs的制备方法包括:在单链DNA中加入TCEP溶液,以实现对巯基的活化,然后向该反应体系中加入金纳米粒子,震荡孵育,得到DNA-AuNPs复合物;
(3)滚环扩增模板,其制备方法包括:在T4 DNA连接酶的作用下,使滚环链和靶链形成闭合的滚环模板链;加入核酸外切酶,移除未结合的DNA链,形成具有进行扩增反应功能的滚环模板链;
所述靶链的核苷酸序列为5’-AATACTGAACAAAAAGCTATTATT TT-3’(SEQ ID NO:7);
所述滚环链的核苷酸序列为5’- P-CTTTTTGTTCAGTATTCAGA TTCAGGACAGTGGGTGGAACTCGAGATGCTTAGGTTAATATCAAAAAATAATAG-3’(SEQ ID NO:8)。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其中,修饰了DNA四面体链的AuNPs的制备方法包括:将2-3 μL、0.4-0.6 M的三(2-羧乙基)膦溶液加入80-120 μL、8-12 μM的DNA单链中,震荡孵育20-40 min,活化巯基;向活化了巯基后的DNA中加入600-800 μL、粒径为2-4 nm的AuNPs溶液,孵育1-3 h,并在24 h内,分四次向混合液中加入NaCl溶液,直至NaCl的终浓度为45-55 mM;然后将样品以12000-13000 rpm离心8-12 min,除去溶液中未偶联的DNA链,除去上清液,重复三次;最终的沉淀重悬于1×TBE缓冲液中。
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其中,AuNPs四面体的制备方法包括:将带有互补单链DNA的两个DNA-AuNPs复合物混合于1×TBE缓冲液,40-60 nM NaCl中,将混合物放置于水浴锅中,在85-95℃中加热4-6 min,并在水浴锅中缓慢冷却至室温;高温使长链DNA变性,而随着缓慢降温的过程,DNA发生互补配对过程,并逐渐形成预期结构;将两个形成预期结构的DNA-AuNPs复合物混合于1×TBE缓冲液,40-60 nM NaCl中,室温下震荡孵育24 h,分别在转速8000、6000、5000 rpm离心10 min,除去上清液,重复三次,最终重悬于1×TBE缓冲液中,即得到所需的金四面体。
4.根据权利要求1所述的试剂盒,其中,滚环扩增模板的制备方法包括:取150-250 μL的离心管,向其中加入0.8-1.2 μL滚环链、3 μL靶链、0.8-1.2μL T4 DNA连接酶缓冲液,4-6μL dd水;震荡2-4 min,离心0.8-1.2 min;在95℃下孵育4-6 min,55-65℃下孵育40-60min;然后加入0.8-1.2 μL T4 DNA连接酶,震荡混合,离心0.8-1.2 min,并在15-18℃孵育1-3 h,60-70℃下孵育8-12 min以灭活T4 DNA连接酶,终止反应;向上述反应体系中加入1-3 μL核酸外切酶 I、1-3 μL核酸外切酶 III、1-3 μL核酸外切酶I缓冲液、1-3 μL核酸外切酶III缓冲液、以及1-3 μL dd水,震荡混匀,离心0.8-1.2 min;在37℃下孵育30-50 min,并在70-90℃下孵育4-6 min灭活酶活性,终止反应。
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