[发明专利]一种基于特征压缩和噪声抑制的心室图像分割方法有效
申请号: | 202110417511.3 | 申请日: | 2021-04-19 |
公开(公告)号: | CN113112484B | 公开(公告)日: | 2021-12-31 |
发明(设计)人: | 舒明雷;解洪富;王英龙 | 申请(专利权)人: | 山东省人工智能研究院;山东科技大学 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/11;G06T5/00;G06K9/62;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 济南泉城专利商标事务所 37218 | 代理人: | 支文彬 |
地址: | 250013 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 特征 压缩 噪声 抑制 心室 图像 分割 方法 | ||
1.一种基于特征压缩和噪声抑制的心室图像分割方法,其特征在于,包括如下步骤:
a)读取心室分割数据集中的心脏图像数据Image及与心脏图像数据Image对应的掩码Mask;
b)调整心脏图像数据Image和掩码Mask的形状后合并得到双通道矩阵matrix;
c)对双通道矩阵matrix执行N次剪裁,剪裁大小为M×M,对剪裁后的双通道矩阵matrix执行通道分解,得到M大小的心脏图像image和M大小的掩码mask各N张;
d)对N张心脏图像image分别进行归一化处理得到N张处理后的心脏图像img;
e)将N张处理后的心脏图像img和N张掩码mask划分为训练集、验证集和测试集;
f)计算机读取训练集和验证集中的心脏图像img和掩码mask,将读取的心脏图像img记作x,将读取的掩码mask记作y,完成训练数据的加载;
g)选择SGD作为优化器,优化器的初始学习率为0.001,并使用学习率自适应调整策略;
h)将x输入卷积层进行卷积运算,后输入BN层进行规范化处理,规范化处理后由ReLU激活函数进行激活;
i)重复执行步骤h)一次,得到特征图M,对特征图M使用池化核为2*2,stride为2的maxpool层进行特征下采样,得到下采样特征MP;
j)对下采样特征MP进行噪声抑制和特征融合后得到输出特征SMindex,步骤j)包括如下步骤:
j-1)通过公式计算噪声抑制后的特征矩阵YM,MPi(r,c)为输入的下采样特征MP的第i个通道的第r行第c列的元素值,i∈[0,C),r∈[1,size],c∈[1,size],C为输入的下采样特征MP的通道总数,size为下采样特征MP的长宽尺寸,size=352;
j-2)通过公式计算相似度Sij,式中YMi(r,c)为特征矩阵YM的第i个通道的第r行第c列的元素值,为特征矩阵YM的第i个通道的所有元素的平均值,YMj(r,c)为特征矩阵YM的第j个通道的第r行第c列的元素值,为特征矩阵YM的第j个通道的所有元素的平均值,i∈[0,C),j∈[0,C),j>i;
j-3)选取值大于0.9的相似度Sij,以第i个通道为基准进行分类,形成列表{i,j1,...,jn},将列表{i,j1,...,jn}记作Ti,n为与通道i相似的通道的个数;j-4)通过公式计算得到融合特征Subi,YMk为特征矩阵YM的第k个通道;
j-5)选取压缩倍率rate=0.5,将步骤j-4)中融合特征时未使用的通道与融合特征Subi进行拼接得到CM,对CM的通道进行随机切分或复制操作,得到通道数为的输出特征SMindex;
k)对输出特征SMindex使用若干卷积操作组计算得到特征图CSMindex;
l)对特征图CSMindex使用与步骤i)中的相同的maxpool层进行特征下采样,得到下采样特征MSMindex;
m)重复执行步骤j)至步骤l)3次后,再重复步骤j)至步骤k),得到最终的输出特征FM;
n)使用DUC结构对FM进行处理,得到最终的分割输出
o)通过公式计算每类的损失调整权重μk,式中num为像素点总数,numk为第k类的像素点数量,通过公式计算网络前向传播的损失值loss,式中yk为真实值y中属于第k类的值,为预测值中属于第k类的值,K为网络需要分割的类别总数;
p)根据损失loss调整权重,使用反向传播算法更新步骤h)和步骤k)中的卷积操作组的权重和偏置;
q)重复步骤f)至步骤p)若干次,之后保存模型及其权重;
i)读取测试集的心脏图像imgt及其掩码maskt,将imgt输入到步骤q)保存的模型中,得到预测的分割掩码pre,使用pre和maskt计算mIoU值;
s)如果mIoU值大于等于0.95则将步骤q)中保存的模型作为最终模型Model,如果mIoU值小于0.95,则重复执行步骤f)至步骤i)直至mIoU值大于0.95;
t)将DICOM格式的心脏影响数据解析为普通的JPG格式的图像后将JPG图像剪裁,剪裁后的JPG图像归一化处理后输入到步骤s)中的模型Model中进行心室分割,得到最终的心室分割掩码。
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