[发明专利]一种鸭剩余采食量相关的lncRNA及其应用

说明书

本发明涉及分子生物学技术领域，尤其涉及一种鸭剩余采食量相关的lncRNA及其应用。发明通过利用RNA‑Seq技术和生物信息学方法，比较分析鸭高、低剩余采食量肝脏组织基因表达谱，鉴定筛选与剩余采食量及脂代谢相关的关键差异表达lncRNA。结果显示lncRNA及其靶基因GSK3β、ACVR1B、SORBS1均与鸭的剩余采食量有关。本发明为鸭饲料利用率性状的分子机制研究奠定理论基础，在高饲料利用率鸭新品种和新品系分子育种方面具有广阔的应用前景。

技术领域

本发明涉及分子生物学技术领域，尤其涉及一种鸭剩余采食量相关的lncRNA及其应用。

技术背景

剩余采食量指畜禽实际采食量与用于维持和生长的预期采食量的差值，其反映的是由于畜禽本身遗传背景的不同而导致的饲料利用率的差异(Aggrey etal.,2010)，可用做衡量饲料利用率的有效指标，一般来说，低剩余采食量对饲料利用优于高剩余采食量。研究表明，剩余采食量是中等遗传力性状，其遗传力一般0.25～0.45(Zhang,et al.,2017)，表明不同个体间存在着大量的遗传变异，可以通过有效的个体选择或家系选择在不影响家畜生长、育肥及繁殖性能的前提下，对剩余采食量遗传改良，提高饲料利用率，降低饲养成本。因此，选育低剩余采食量鸭群，有利于降低成本。

影响剩余采食量的因素主要包括机体组成、营养物质的消化率、新陈代谢能力、免疫反应、能量代谢等因素，其中脂代谢是影响家禽剩余采食量的重要因素之一(Yang etal.,2019；Zabielski et al.,2019)。肝脏是动物体内重要的器官，在糖、脂肪和蛋白质等物质代谢和能量平衡中起重要作用。已有研究表明，脂类代谢沉积与饲料利用率呈显著相关。脂类代谢是影响肉鸭剩余采食量的重要因素，且与脂类代谢相关的基因在低剩余采食量组个体中高表达。鉴于此，肝脏脂代谢是影响动物剩余采食量的重要因素。

长链非编码RNA(Long non-coding RNA，lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸的RNA，可从多层面调控基因表达，进而影响表型性状(Weikard et al.,2017)。研究表明lncRNAs通过转录调控、转录后调控和表观遗传调控等多种方式调节基因的表达。LncRNAs作为一大类具有调控作用的RNA，在生物的生长、发育、代谢等方面发挥着巨大的作用。lncRNA可通过“cis”方式对临近mRNA的进行转录激活与表达调控，还可通过“trans”方式调控相距较远或在不同染色体上的编码蛋白基因。研究表明，lncRNA作为重要的调控因子在肝脏脂代谢过程中起着重要作用。

发明内容

为了解决现有技术中存在的问题，本发明提供了一种与鸭的剩余采食量相关的LncRNA，该LncRNA命名为XR_001191699.1，其序列为SEQ ID NO.1。

本发明另一目的在于提供所述lncRNA的应用，该lncRNA用于预测或辅助预测高饲料利用率鸭；或用于选育不同饲料利用率鸭。

本发明还提供了所述lncRNA的另一应用，该lncRNA用于制备检测鸭饲料利用率的试剂。

优选的，试剂通过核酸扩增技术检测所述lncRNA的表达水平，用于核酸扩增的引物序列对为：

正向序列SEQ ID NO.2：CCAGCATTCTCGTCTT

反向序列SEQ ID NO.3：CTTATAGTCGTGCCAGCGT。

优选的，该试剂通过核酸扩增技术检测所述lncRNA的靶基因的表达水平。

优选的，所述靶基因为GSK3β和/或ACVR1B和/或SORBS1。

优选的，扩增所述GSK3β的引物序列对为：

正向序列SEQ ID NO.4：GGGCGAGATAAACCTGCACT；反向序列SEQ ID NO.5：GCTGTAGCGTTTGTAGGGGT；