[发明专利]一种重组突变型Tn5转座酶的制备及应用有效
申请号: | 202110445159.4 | 申请日: | 2021-04-25 |
公开(公告)号: | CN113136374B | 公开(公告)日: | 2022-10-21 |
发明(设计)人: | 吕培涛;朱文俊 | 申请(专利权)人: | 福建农林大学 |
主分类号: | C12N9/12 | 分类号: | C12N9/12;C12N15/10;C12N15/62;C07K19/00;C12N15/70;C12Q1/6806 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人: | 刘佳;蔡学俊 |
地址: | 350002 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 重组 突变型 tn5 转座酶 制备 应用 | ||
1.一种重组突变型Tn5转座酶,其特征在于,所述重组突变型Tn5转座酶构建方法包括:
(1)以原突变型Tn5转座酶基因为模板,进一步改造突变M56A与E345K两个位点,获得Tn5m核苷酸片段;
(2)将Tn5m核苷酸片段与EF或TRX1核苷酸片段通过重组反应,获得EF-Tn5m转座酶或TRX1-Tn5m转座酶的核苷酸片段;
(3)所述EF-Tn5m转座酶的氨基酸序列如SEQ ID NO.4所示,核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示;所述TRX1-Tn5m转座酶的氨基酸序列如SEQ ID NO.6所示,核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示;
步骤(1)所述改造突变M56A与E345K两个位点所需要的引物包括:
56A-F:5′-GGCAGCAAAGCCGCCCAGGAAGGCGCGTAT-3′;
56A-R:5′-ATACGCGCCTTCCTGGGCGGCTTTGCTGCC-3′;
345K-F:5′-CAGCGTATGGAAAAACCGGATAACCTG-3′;
345K-R:5′-CAGGTTATCCGGTTTTTCCATACGCTG-3′。
2.一种包含权利要求1所述重组突变型Tn5转座酶的核苷酸序列的载体,其特征在于,将所述EF-Tn5m转座酶、TRX1-Tn5m转座酶的核苷酸片段利用同源重组分别克隆到表达载体pET30a中。
3.一种利用权利要求2所述载体表达制备重组突变型Tn5转座酶的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)将表达载体转入C3013感受态细胞中,放入冰上孵育30 min,再热激60 s,随后冰上孵育5 min;加入200 μL LB液体培养基,放入摇床复苏30 min后,涂布于终浓度50 μg/mL卡那霉素固体培养基上,37℃过夜培养;第二天挑取单菌落进行测序验证;
(2)将含有正确目的序列的单菌落接种于10 mL LB液体培养基,37℃培养过夜,从中取1 mL 接种于100 mL LB液体培养基,扩大培养至OD600 = 0.5,加入终浓度0.25 mM的IPTG诱导重组突变型Tn5蛋白表达;诱导6 h后,用50 mL离心管收集菌体,用于蛋白纯化;
(3)向菌体中加入10 mL 结合缓冲液 ,随后于超声波细胞破碎仪中进行菌体破碎,再加入50 μL PEI(Sigma,P3143)沉淀菌液中的DNA分子,在4℃ 12 ,000
(4)重组突变型Tn5转座酶装配:分别按摩尔比ME-A:ME-R = 1:1,ME-B:ME-R = 1:1进行混匀并退火形成Tn5 接头A和接头B,然后将接头A与接头B等体积比混合,得到Tn5接头AB;将步骤(3)所述重组突变型Tn5蛋白溶液进行超滤浓缩并用储存缓冲液置换,再按体积比1:0.5;1:1和1:2加入混合的Tn5接头AB,最后加入终浓度为50%的甘油,混合均匀,20℃孵育40 min;
所述储存缓冲液配方为:20 mM Tris-HCl pH 8.0;0.15 M NaCl;1 mM EDTA;
结合缓冲液配方为:10 mM Tris-HCl pH 8.0;1 M NaCl;1 mM EDTA;10%甘油;0.1%Triton X-100;
漂洗缓冲液配方为:10 mM Tris-HCl pH 8.0;2 M NaCl;1 mM EDTA;10%甘油;0.1%Triton X-100;
洗脱液配方为:20 mM Tris-HCl pH 8 .0;0.5 M NaCl;1 mM EDTA;50 mM DTT。
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